| 大白菜乙烯受体基因家族分子特征、微同线性与进化分析 |
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| 引用本文： | 朱红霞,胡利宗,邓小莉.大白菜乙烯受体基因家族分子特征、微同线性与进化分析[J].生物技术通报,2011(7). |
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| 作者姓名： | 朱红霞 胡利宗 邓小莉 |
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| 作者单位： | 1. 新乡学院,新乡,453003
2. 中科院遗传发育所,北京,100101 |
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| 摘 要： | 采用HMMER与BLAST相结合的方法,在大白菜基因组中挖掘了10个大白菜ERT基因,被命名为BraERT1-10.基因结构分析显示,乙烯受体基因的外显子数目变异大,其范围为1-15.微同线性结果表明,白菜与拟南芥间以及白菜基因组内共有5对基因区段具有较高同线性,每对基因区段间至少共享了8个保守序列模块.蛋白保守结构域和亚细胞定位分析表明,BraERT1、BraERT2和BraERT8都具有N端疏水区域、GAF区、HisKA区、反应调节区,分别被定位于质膜、叶绿体和线粒体；BraERT3、BraERT4和BraERT7虽然有N端疏水区域、GAF区和HisKA区,但没有完整的反应调节区,分别被定位于质膜、质膜和胞质外；其余4个蛋白不具有典型区域,主要定位于核和叶绿体内.进化树结果显示,大白菜ERT基因具有3种类型,分别归属于不同3个类群.本研究为大白菜ERT基因功能研究提供线索,为进一步解析大白菜乙烯信号途径奠定基础.
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| 关 键 词： | 大白菜 乙烯受体 基因家族 进化 |
Molecular Characterization, Microsynteny and Evolutionary Analysis of Ethylene Receptor Gene Family in Brassica rapa |
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| Zhu Hongxia,Hu Lizong,Deng Xiaoli.Molecular Characterization, Microsynteny and Evolutionary Analysis of Ethylene Receptor Gene Family in Brassica rapa[J].Biotechnology Bulletin,2011(7). |
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| Authors: | Zhu Hongxia Hu Lizong Deng Xiaoli |
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