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棕色棉F3'H-羟化酶基因的克隆与生物信息学分析
引用本文:梁明炜,刘海峰,肖向文,陆雪莹,李艳红,宋武,鲁春芳,李晓波.棕色棉F3'H-羟化酶基因的克隆与生物信息学分析[J].生物技术通报,2011(11).
作者姓名:梁明炜  刘海峰  肖向文  陆雪莹  李艳红  宋武  鲁春芳  李晓波
作者单位:1. 中国科学院新疆理化技术研究所新疆植物资源化学重点实验室,乌鲁木齐,830011
2. 中国彩棉(集团)股份有限公司,乌鲁木齐,830016
基金项目:中国科学院新疆理化技术研究所博士启动资金项目,中国科学院“西部之光”人才培养计划项目(RCPY200802); 转基因生物新品种培育重大专项项目(2009ZX08005-027B)
摘    要:根据葡萄的类黄酮3′-羟化酶(F3'H)基因全长cDNA序列Blast所得棉花的EST序列设计引物,以开花后16 d(DPA16)的新彩棉5号(xC-5)纤维为材料,利用RACE和RT-PCR技术分离得到了2个类黄酮3′-羟化酶基因cDNA序列,此2个序列编码区完全相同,仅在3'UTR区存在片段长短的差异,推测可能是基因转录后加工方式不同所造成.克隆所获得的棉花F3'H基因编码区全长1 533 bp,编码510个氨基酸,氨基酸序列分析预测表明,该基因所编码蛋白含有一个跨膜结构域,是一种分泌蛋白,定位于内质网上,并含有一段与细胞色素P450功能区相匹配的保守功能域;序列比对结果表明,棉花F3'H基因与其他多个物种的F3'H基因在氨基酸序列上有较高的同源性;聚类分析结果表明,棉花F3'H蛋白与双子叶植物大豆的F3'H亲缘关系较为接近,而与单子叶植物高梁等作物则较远.

关 键 词:类黄酮3′-羟化酶  棕色棉  RACE  序列分析

Cloning and Bioinformatics Analysis of Flavonoid 3'-Hydroxylase Gene GhF3'Hin Brown Cotton (Gossypium hirsutum L.) Fibers
Liang Mingwei,Liu Haifeng,Xiao Xiangwen,Lu Xueying,Li Yanhong,Song Wu,Lu Chunfang,Li Xiaobo.Cloning and Bioinformatics Analysis of Flavonoid 3'-Hydroxylase Gene GhF3'Hin Brown Cotton (Gossypium hirsutum L.) Fibers[J].Biotechnology Bulletin,2011(11).
Authors:Liang Mingwei  Liu Haifeng  Xiao Xiangwen  Lu Xueying  Li Yanhong  Song Wu  Lu Chunfang  Li Xiaobo
Institution:Liang Mingwei1 Liu Haifeng2 Xiao Xiangwen1 Lu Xueying1 Li Yanhong1 Song Wu2 Lu Chunfang1 Li Xiaobo1(1Xinjiang Technical Institute of Physics and Chemistry,Chinese Academy of Sciences,Xinjiang Key Laboratory of Plant Resource and Natural Products Chemistry,Urumqi 830011,2China Colored-Cotton(group) Co.,Ltd.,Urumqi 830016)
Abstract:
Keywords:
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