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基于简并引物同步克隆两个红麻PDIL同源基因cDNA5'-末端序列
引用本文:金刚,陈鹏,唐向民,周瑞阳. 基于简并引物同步克隆两个红麻PDIL同源基因cDNA5'-末端序列[J]. 生物技术通报, 2011, 0(10)
作者姓名:金刚  陈鹏  唐向民  周瑞阳
作者单位:广西大学植物遗传育种重点实验室,南宁,530005
基金项目:国家自然科学基金项目(30900912,31060199); 国家麻类产业技术体系建设专项资金项目(nyctx-19-E16)
摘    要:探索利用同一套简并引物结合通用引物同步扩增两个红麻PDIL同源基因的cDNA5’-末端序列,以期为同一转录组中两个旁系同源基因cDNA5' RACE的同步扩增提供借鉴.通过红麻HcPDIL5-2a和HcPDIL5-2b cDNA中间片段及3’-末端已知序列的比时,在其完全保守区段设计了一条引物用于两个基因5' RACE的共反转录;在其部分保守区段设计了两条简并引物,并利用其在两个基因的5'RACE扩增时退火温度的差异,结合通用引物巢式PCR同步扩增两个基因的cDNA 5 ’-末端未知序列.在两个基因全长cDNA拼接序列的基础上设计两对特异引物分别扩增它们的cDNA全长序列,测序结果进一步验证了序列拼接和cDNA 5' RACE同步扩增的可靠性.进化分析证实两个基因属于PDIL基因家族成员.

关 键 词:红麻  简并引物  5'RACE  同步克隆

Synchronous Cloning of 5' cDNA End of Two PDIL Homologous Gene from Kenaf( Hibiscus cannabinus L.) Using Degenerate Primers
Jin Gang,Chen Peng,Tang Xiangmin,Zhou Ruiyang. Synchronous Cloning of 5' cDNA End of Two PDIL Homologous Gene from Kenaf( Hibiscus cannabinus L.) Using Degenerate Primers[J]. Biotechnology Bulletin, 2011, 0(10)
Authors:Jin Gang  Chen Peng  Tang Xiangmin  Zhou Ruiyang
Affiliation:Jin Gang Chen Peng Tang Xiangmin Zhou Ruiyang(Provincial Key Laboratory of Plant Genetics & Breeding,Guangxi University,Nanning 530005)
Abstract:
Keywords:
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