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文冠果果实转录组测序及分析
引用本文:赵阳阳,郭雨潇,张凌云.文冠果果实转录组测序及分析[J].生物技术通报,2019(6).
作者姓名:赵阳阳  郭雨潇  张凌云
作者单位:北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室
摘    要:为了研究文冠果果实转录组中功能基因表达情况,采样RNA-seq技术对文冠果不同发育时期果实进行测序分析。结果显示:两个时期样品材料测序组装后共获得68 298个Unigene序列,有24 691个Unigene得到注释,占36.15%;GO数据库注释显示14 766条Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程3大类54个功能组;KOG数据库中注释到的13 994条Unigene功能系统分为25类;以KEGG代谢途径数据库为依据,可将8 284个文冠果果实转录组Unigene分为127个代谢通路;在文冠果果实转录组中发现11 732个SSR位点,其中最多的为单核苷酸SSR,占60.85%。本研究为文冠果果实分子生物学研究提供了一定的基础和参考。

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