美沙拉秦干预下IBD小鼠结肠组织的转录组分析

目的 应用转录组测序技术(RNA sequencing, RNA-seq)检测炎症性肠病(inflammatory bowel disease, IBD)小鼠结肠组织的基因表达变化，增进对美沙拉秦(5-aminosalicylic acid, 5-ASA)治疗IBD的分子机制的理解。方法 用葡聚糖硫酸钠(dextran sulfate sodium, DSS)建立IBD小鼠模型。将15只C57BL/6小鼠随机均分为三组：对照组、DSS组和DSS+5-ASA组。每组随机选择3只小鼠取结肠组织进行测序，经两组间比较，鉴定差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)及重要生物学信号通路。随后通过基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)中溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)患者和经美沙拉秦治疗后患者结肠组织活检的微阵列(microarray)数据，验证前面鉴定得到的子显著DEGs。结果 DSS+5-ASA组与DSS组比较中共得到2983个差异表达基因，上调基因604个，下调基因753个；DSS...