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美沙拉秦干预下IBD小鼠结肠组织的转录组分析
引用本文:王怡如,周唯,蒋笑影,潘一滨,许言午,曹永清.美沙拉秦干预下IBD小鼠结肠组织的转录组分析[J].中国实验动物学报,2022(1):7-16.
作者姓名:王怡如  周唯  蒋笑影  潘一滨  许言午  曹永清
作者单位:1. 上海中医药大学附属龙华医院肛肠科;2. 上海中医药大学基础医学院生物化学教研室
基金项目:国家自然科学基金资助课题(81874469,81202696)~~;
摘    要:目的 应用转录组测序技术(RNA sequencing, RNA-seq)检测炎症性肠病(inflammatory bowel disease, IBD)小鼠结肠组织的基因表达变化,增进对美沙拉秦(5-aminosalicylic acid, 5-ASA)治疗IBD的分子机制的理解。方法 用葡聚糖硫酸钠(dextran sulfate sodium, DSS)建立IBD小鼠模型。将15只C57BL/6小鼠随机均分为三组:对照组、DSS组和DSS+5-ASA组。每组随机选择3只小鼠取结肠组织进行测序,经两组间比较,鉴定差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)及重要生物学信号通路。随后通过基因表达数据库(gene expression omnibus, GEO)中溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)患者和经美沙拉秦治疗后患者结肠组织活检的微阵列(microarray)数据,验证前面鉴定得到的子显著DEGs。结果 DSS+5-ASA组与DSS组比较中共得到2983个差异表达基因,上调基因604个,下调基因753个;DSS...

关 键 词:炎症性肠病  美沙拉秦  葡聚糖硫酸钠  转录组测序  差异表达基因
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