C型斜纹夜蛾核型多角体病毒X17病毒株部分基因的序列分析

斜纹夜蛾核型多角体病毒（Spodoptera litura multinucleocapsid nucleopolyhdrovirus， SpltMNPV）X₁₇株是采用活体克隆法自SpltMNPV日本小笠原株分离的病毒克隆。为了揭示X₁₇病毒株基因型， 根据已发表的SpltMNPVⅡ基因组全序列（GenBank登录号： NC_011616）设计引物， PCR扩增多角体蛋白基因（polh）， 并与SpltMNPV不同基因型及37种其他核型多角体病毒（NPV）作分子进化比较。系统发育树显示： SpltMNPV分为SpliNPV（A）型、 SpltMNPV（B）型和SeMNPV（C）型3种基因型， 此结果与前人利用基因组酶切图谱的研究结果一致。X₁₇与SpltMNPV-1和SpltMNPVⅡ处于一个分支， 属于SeMNPV（C）基因型， 与A型和B型相距较远。此外， 扩增了X₁₇病毒基因38.7kD，Lef-1，Lef-9，fp，p10和p74， 并与SpltMNPV， SpltMNPVⅡ， SeMNPV和SfNPV的同种基因进行同源性比较。结果表明， 基于这6个ORF， X₁₇与SpltMNPV同源性最低， 其中Lef 9的氨基酸序列一致性最高， 也仅为69%， 38.7kD的氨基酸序列一致性只为26%。多数基因X17与SpltMNPVⅡ和SeMNPV的同源性较高， 其中fp25K的氨基酸序列一致性最高， 分别达95%和96%； 但也有些基因同源性较低， 如38.7kD的氨基酸序列一致性均为64%。因此， X₁₇应是SpltMNPV C基因型的一种新毒株， 命名为SpltMNPVⅡ-1。该研究为X₁₇病毒株的进一步研究利用奠定基础。

Sequence analysis of some genes in X_(17) strain of Spodoptera litura multinucleocapsid nucleopolyhedrovirus C genotype

SpltMNPV X17 was isolated from the stock collected in Ogasawara Island,Japan,by in vivo cloning techniques.In order to reveal its genotype,the primer was designed according to the complete genome sequence deposited in GenBank under accession no.NC_011616.The polyhedrin gene of X17 was amplified by PCR,and then the neighbor-joining tree based on nucleotide sequences of the polyhedron gene between SpltMNPV different genotypes including X17 and 37 NPVs was constructed.The phylogenetic tree indicated that SpltM...