楸树DELLA基因家族生信分析及CbuGRAS9的功能分析 |
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引用本文: | 王珊珊,王瑞,樊二勤,付鹏跃,曲冠证,王楠.楸树DELLA基因家族生信分析及CbuGRAS9的功能分析[J].植物研究,2024(1):139-151. |
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作者姓名: | 王珊珊 王瑞 樊二勤 付鹏跃 曲冠证 王楠 |
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作者单位: | 1. 林木遗传育种全国重点实验室,东北林业大学;2. 中国林业科学研究院 |
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基金项目: | 国家重点研发计划项目(2021YFD2200202); |
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摘 要: | 通过鉴定楸树(Catalpa bungei)DELLA家族基因并分析CbuGRAS9的基因功能,为楸树生殖调控性状的遗传改良提供理论依据。基于楸树基因组数据,鉴定并克隆了5个与拟南芥(Arabidopsis thaliana)同源的CbuDELLAs基因;利用ExPASy、SWISS-MODEL、Plant-mPloc、PlantCare等在线工具对CbuDELLAs蛋白进行等电点、蛋白结构、亚细胞定位及启动子顺式作用元件预测;以9-1(Catalpa bungei ‘Luoqiu No.1’)和‘百日花’楸树(Catalpa ‘Bairihua’)为材料,分析了CbuDELLAs基因的表达量差异,并通过异源转化拟南芥证实了CbuGRAS9的分子功能,利用酵母双杂交文库筛选了与CbuGRAS9互作的蛋白。结果表明:5个CbuDELLAs蛋白的氨基酸数目为455~588,蛋白相对分子质量为5.04~6.43 kDa,等电点为4.81~5.14;CbuDELLAs蛋白均含有DELLA和GRAS保守结构域,全部为亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果显示CbuDELLAs蛋白均定位于细胞核中。启动子...
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关 键 词: | 楸树 DELLAs 生物信息学分析 功能分析 互作蛋白 |
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