| DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率 |
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| 引用本文： | 杨永强,焦仁刚,龚俞,惠嫣婷,刘若余.DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率[J].生物技术,2012,22(5). |
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| 作者姓名： | 杨永强 焦仁刚 龚俞 惠嫣婷 刘若余 |
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| 作者单位： | 1. 贵州大学动物科学学院,高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室;贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵州贵阳550025
2. 贵州省畜牧技术推广站,贵州贵阳,550001 |
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| 基金项目： | 贵州省重大科技专项计划项目 |
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| 摘 要： | 目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据.方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp.切胶回收后对PCR产物进行双向测序.结果:在牛STAM1基因中快速筛查到5个SNPs:A33C、C66G、C356T、T523A、T652C,其中A33C(Tyr→Ser)、C66G(Pro→Arg)、C356T(Glu→Lys)为错义突变,T523A为同义突变,T652C位于内含子区.贵州荷斯坦奶牛在T523A和T652C两个位点基因频率为1.0000,而务川黑牛分别为0.6730和0.8106.生物信息学分析表明:突变前后STAM1的RNA二级结构和蛋白质二级、三级结构均有明显改变.结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,检测到STAM1基因第14外显子5个SNPs.
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| 关 键 词： | STAM1 DNA池 务川黑牛 贵州荷斯坦奶牛 SNPs JAK/STAT |
Rapidly Screening SNPs of Cattle STAM1 Gene and Estimating Allelic Frequencies by DNA Pooling |
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| YANG Yong-qiang
,
JIAO Ren-gang
,
GONG Yu
,
HUI Yan-ting
,
LIU Ruo-yu.Rapidly Screening SNPs of Cattle STAM1 Gene and Estimating Allelic Frequencies by DNA Pooling[J].Biotechnology,2012,22(5). |
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| Authors: | YANG Yong-qiang JIAO Ren-gang GONG Yu HUI Yan-ting LIU Ruo-yu |
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