| 石榴WRKY基因家族全基因组鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 任 媛,赵玉洁,张心慧,招雪晴,苑兆和.石榴WRKY基因家族全基因组鉴定与表达分析[J].西北植物学报,2020,40(2):218-231. |
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| 作者姓名： | 任 媛 赵玉洁 张心慧 招雪晴 苑兆和 |
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| 作者单位： | (1 南京林业大学 南方现代林业协同创新中心， 南京 210037； 2 南京林业大学 林学院，南京 210037) |
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| 基金项目： | 西藏自治区自然科学基金(XZ2019 ZR G 153)； |
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| 摘 要： | WRKY蛋白是一类在植物生长发育过程及生物与非生物胁迫过程中起重要调控作用的转录因子。该研究利用石榴全基因组数据,采用生物信息学的方法,对石榴WRKY转录因子家族成员蛋白理化性质、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白互作及基因共表达和转录组表达模式进行系统分析。结果共鉴定出69个PgWRKY基因;分组鉴定和进化分析显示WRKY蛋白可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ共三大类型。顺式作用元件分析表明,PgWRKY基因广泛参与到非生物胁迫中;蛋白互作网络与共表达分析暗示PgWRKY基因在同一胁迫应答中可能作用一致并同时诱导表达;RNA-Seq数据分析表明,PgWRKY基因有一定的组织表达特异性,广泛参与植物营养、生殖生长以及根部逆境胁迫应答过程。
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| 关 键 词： | 石榴 WRKY基因家族 进化分析 表达分析 |
Genome wide Identification and Expression Analysis of WRKY Gene Family in Punica granatum |
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| REN Yuan,ZHAO Yujie,ZHANG Xinhui,ZHAO Xueqing,YUAN Zhaohe.Genome wide Identification and Expression Analysis of WRKY Gene Family in Punica granatum[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2020,40(2):218-231. |
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| Authors: | REN Yuan ZHAO Yujie ZHANG Xinhui ZHAO Xueqing YUAN Zhaohe |
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| Institution: | (Southern Modern Forestry Collaborative Innovation Center, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China;2School of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Punica granatum WRKY phylogenetic analysis expression analysis |
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