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上海地区H9N2亚型禽流感病毒的遗传演化分析
引用本文:李鑫,葛菲菲,刘健,鞠厚斌,杨德全,周锦萍,刘佩红. 上海地区H9N2亚型禽流感病毒的遗传演化分析[J]. 微生物与感染, 2015, 0(2)
作者姓名:李鑫  葛菲菲  刘健  鞠厚斌  杨德全  周锦萍  刘佩红
作者单位:上海市动物疫病预防控制中心,上海,201103
基金项目:上海市市级农口系统青年人才成长计划〔沪农青字(2014)第2-8号〕
摘    要:为阐明上海地区 H9N2亚型禽流感病毒分离株的遗传变异、分子特征和重组模式,选取2002和2006~2014年分离自活禽市场、家禽养殖场和生猪屠宰场的14株 H9N2亚型禽流感病毒进行分析。这14株病毒分别来源于鸡、鸭、鸽、野鸡咽喉和泄殖腔样品及猪肺脏样品,用 H9亚型荧光反转录‐聚合酶链反应(RT‐PCR)试剂盒检测后,阳性样品经无特定病原体(SPF)级鸡胚尿囊腔接种并分离病毒,用血凝抑制(HI)实验进一步确定其血凝素(HA)亚型。RT‐PCR分别扩增这14株病毒全基因并进行序列测定,分析8个基因片段的遗传发生关系,发现这些分离株主要由 F/98亚系、Y280亚系、G1亚系及未知亚系重组而成。根据8个基因片段的组合情况,这14株病毒可分成5个基因型。2002、2006~2008年分离的5株H9N2亚型禽流感病毒代表了4个不同基因型,2009~2014年分离的9株H9N2亚型禽流感病毒属第5种基因型,推测可能与疫苗免疫选择压力有关。因此,在以后工作中加强H9N2亚型禽流感分子流行病学监测是非常必要的。

关 键 词:H9N2亚型禽流感  序列测定  系统发育分析

Phylogenetic analysis of H9N2 subtype avian influenza virus isolated in Shanghai
LI Xin,GE Fei-Fei,LIU Jian,JU Hou-Bin,YANG De-Quan,ZHOU Jin-Ping,LIU Pei-Hong. Phylogenetic analysis of H9N2 subtype avian influenza virus isolated in Shanghai[J]. Journal of Microbes and Infection, 2015, 0(2)
Authors:LI Xin  GE Fei-Fei  LIU Jian  JU Hou-Bin  YANG De-Quan  ZHOU Jin-Ping  LIU Pei-Hong
Abstract:
Keywords:H9N2 subtype avian influenza  Sequence determination  Phylogenetic analysis
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