鲤形目五种鱼α-珠蛋白基因cDNA的克隆

从血液中提取总RNA，根据α珠蛋白氨基配序列的N末端和C末端碱基序列的保守性设计20个碱基长的简并引物，用RT-PCR方法扩增并克隆了鲤鱼(Cyprinus carpio)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鲫鱼(Carassius auratus)、泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)和大鳞副泥鳅(Paramisgurnus dabryanus)5种我国常见鱼类的α-珠蛋白基因cDNA。序列同源性检索表明：所克隆的cDNA片段为这5种鱼各自的α-珠蛋白基因，其GenBank注册号分别为AF528156、AF528157、AF528197、AF528198、AF528199；克隆的5种鱼的α-珠蛋白基因氨基配编码序列均为429bp。氨基配序列比较后发现：泥鳅与大鳞副泥鳅的相似性最高为94．41％；大鳞副泥鳅与草鱼的相似性最低为83．92％；其余的相似性介于二者之间。另外，对已克隆的α-珠蛋白基因用Within-group方法进行了聚类分析，聚类结果显示：进化关系较近的物种α-珠蛋白氨基酸序列的相似性与其从形态解剖所得的系统进化关系是一致的；进化关系较远的物种α-珠蛋白氨基酸序列的相似性与其生存环境具有较密切的关系。