| 拟诺卡氏菌16S rRNA,gyrB,sod和rpoB基因的系统发育分析 |
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| 引用本文： | 杨玲玲,职晓阳,李文均.拟诺卡氏菌16S rRNA,gyrB,sod和rpoB基因的系统发育分析[J].微生物学报,2007,47(6). |
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| 作者姓名： | 杨玲玲 职晓阳 李文均 |
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| 作者单位： | 云南大学,微生物研究所,昆明,650091 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划);国家自然科学基金;教育部跨世纪优秀人才培养计划;云南省中青年学术技术带头人后备人才培养计划;云南省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 为了更好地了解拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)各物种间的系统发育关系,该属现有有效描述种的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被测定,结合16S rRNA基因,对拟诺卡氏菌属进行了系统发育重建。研究发现拟诺卡氏菌属gyrB,sod和rpoB基因的平均相似性分别为87.7%、87.3%和94.1%,而16S rRNA基因的平均相似性则达到96.65%,3个看家基因均比16S rRNA具有更高的分歧度。比较基于不同基因的系统树发现,由gyrB基因得到的系统树拓扑结构与16S rRNA得到的结构在亚群上基本一致。因此,gyrB基因在拟诺卡氏菌属的系统分类上比16S rRNA基因更具优越性。
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| 关 键 词： | 拟诺卡氏菌属 系统发育分析 16S rRNA基因 看家基因 |
Phylogenetic analysis of Nocardiopsis species based on 16S rRNA,gyrB, sod and rpoB gene sequences |
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| YANG Ling-ling,ZHI Xiao-yang,LI Wen-jun.Phylogenetic analysis of Nocardiopsis species based on 16S rRNA,gyrB, sod and rpoB gene sequences[J].Acta Microbiologica Sinica,2007,47(6). |
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| Authors: | YANG Ling-ling ZHI Xiao-yang LI Wen-jun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Nocardiopsis Phylogenetic analysis 16S rRNA gene Housekeeping gene |
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