| 胰腺癌中CDK1的表达与预后的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杨万霞,潘云燕,李雪,管沛文,尤崇革.胰腺癌中CDK1的表达与预后的生物信息学分析[J].生命科学研究,2020,24(1):30-38. |
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| 作者姓名： | 杨万霞 潘云燕 李雪 管沛文 尤崇革 |
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| 作者单位： | 兰州大学第二医院检验医学中心,中国甘肃兰州730030;兰州大学第二医院检验医学中心,中国甘肃兰州730030;兰州大学第二医院检验医学中心,中国甘肃兰州730030;兰州大学第二医院检验医学中心,中国甘肃兰州730030;兰州大学第二医院检验医学中心,中国甘肃兰州730030 |
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| 基金项目： | 甘肃省重点研发计划项目;兰大二院萃英计划面上项目;兰大二院萃英计划临床拔尖技术项目 |
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| 摘 要： | 为探讨胰腺癌的发病机制并为胰腺癌的防治提供生物信息学依据,用GEO2R在线工具分析GSE16515中胰腺癌患者肿瘤组织和相应正常组织的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),通过DAVID数据库对DEGs进行GO分析和KEGG通路富集分析,然后通过STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,用Cytoscape软件进行关键基因(hub基因)筛选和功能模块分析,并在GEPIA数据库对hub基因进行验证,用CCLE数据库检测靶基因在胰腺癌组织及细胞系中的表达水平。分析结果显示胰腺癌中筛选出的376个DEGs主要涉及细胞周期、p53信号通路、蛋白质消化吸收、ECM-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、血小板激活信号通路。GEPIA数据库验证结果显示10个hub基因均在胰腺癌组织中高表达,其中8个hub基因与胰腺癌患者的不良预后有关。CCLE数据库检测结果显示周期蛋白依赖性激酶1 (cyclin-dependent kinase 1, CDK1)在胰腺癌组织和细胞中均有较高的表达水平。本研究结果表明CDK1可能与胰腺癌的发生发展最为相关,为进一步探究胰腺癌的发病机制提供了生物信息学依据。
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| 关 键 词： | 胰腺癌 差异表达基因(DEGs) 周期蛋白依赖性激酶1(CDK1) 生物信息学分析 |
Bioinformatics Analysis of CDK1 Expression and Pancreatic Cancer Prognosis |
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