| 基于功能基因组数据整合方法研究前列腺癌风险基因 |
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| 引用本文： | 马晔,田进伟,孙红梅,徐良德. 基于功能基因组数据整合方法研究前列腺癌风险基因[J]. 现代生物医学进展, 2012, 12(31): 6155-6158 |
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| 作者姓名： | 马晔 田进伟 孙红梅 徐良德 |
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| 作者单位： | 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 |
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| 基金项目： | 黑龙江省教育厅科学技术研究项目“糖代谢紊乱与糖尿病及其并发症的分子系统研究”(12511273) |
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| 摘 要： | 目的:利用生物信息学方法,将高通量基因表达数据与单核酸多肽(SNP)基因型数据进行整合分析,研究并注释前列腺癌风险基因。方法:本文基于EST、SAGE、基因芯片三类功能基因组数据整合的方法研究前列腺癌风险基因。首先,通过三类数据寻找前列腺癌中异常表达和差异表达基因。利用全基因组关联分析得到前列腺癌相关基因的SNPs。定位所得到的前例腺癌差异表达基因与SNPs到染色体,获取与SNPs在同一区段的差异表达基因,并通过各种数据库注释所得基因。结果:通过数据整合分析,最终得到前列腺癌风险基因84个,其中20多个基因已被证实与前列腺癌极其相关。结论:整合前列腺癌高通量表达数据与SNP基因型数据,能够快速有效的获得前列腺癌显著相关基因。此方法可以推广于其它癌症的研究。
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| 关 键 词： | 全基因组关联分析 SNP 基因表达 前列腺癌 |
Research Risk Genes of Prostate Cancer based on Functional Genomics Data Integration Method |
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| MA Ye,TIAN Jin-wei,SUN Hong-mei,XU Liang-de. Research Risk Genes of Prostate Cancer based on Functional Genomics Data Integration Method[J]. Progress in Modern Biomedicine, 2012, 12(31): 6155-6158 |
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| Authors: | MA Ye TIAN Jin-wei SUN Hong-mei XU Liang-de |
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| Affiliation: | (College of bioinformatics science and technology,Harbin Medical University,Heilongjiang Harbin,150086,China) |
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| Abstract: | |
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