3株杂色鲍致病菌——副溶血弧菌的16S-23SrDNA间区序列的分析

以细菌的16S rDNA 3′端和23S rDNA 5′端的高度保守区为引物，扩增了3株杂色鲍致病菌—副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus）的16S23S rDNA 间区，克隆到pGEMT载体上，测序。用BLAST和 DNAstar软件对16S23S rDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析。结果表明副溶血弧菌ZSU008和ZSU009测出的16S23S rDNA 间区均有6条，间区类型也相同，分别为IGSGLAV、IGSGLV、IGSAG、IGSIA、IGSG和IGS0。其中IGSGLAV最大，包含tRNAGlu、tRNALys、tRNAAla和tRNAVal基因；IGSGLV包含tRNAGlu、tRNALys和tRNAVal基因；IGSAG包含tRNAAla和tRNAGlu基因；IGSIA，则为tRNAIle和tRNAAla基因；IGSG仅包含tRNAGlu基因；而IGS0最小，未包含任何tRNA。菌株ZSU010测出的16S23S rDNA IGS序列有5条，除缺少IGSAG外，其余的IGS类型均与ZSU008和ZSU009相同。与GenBank 内的副溶血弧菌IGS序列比较，发现副溶血弧菌所有类型的IGS的tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性。16S23S rDNA 间区结构的差异为建立一种新的副溶血弧菌检测方法奠定了基础。