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基于NGS方法评估不同保存条件对粪便样本中菌群含量的影响
引用本文:强裕俊,韩娜,彭贤慧,张婷婷,李秀文,张雯. 基于NGS方法评估不同保存条件对粪便样本中菌群含量的影响[J]. 中国微生态学杂志, 2021, 33(6): 712-717
作者姓名:强裕俊  韩娜  彭贤慧  张婷婷  李秀文  张雯
作者单位:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京 102206
基金项目:国家科技重大专项(2018ZX10305410)和生物安全关键技术研发(2018YFC1200100)
摘    要:目的 评估粪便样本的不同保存条件对肠道微生态研究结果的影响.方法 设计相关实验,比较7种不同的保存方法,基于高通量测序技术比对不同时间、不同贮存温度对粪便样本DNA质量、菌群多样性及病原菌检出等结果之间的差异.结果 证实了对于粪便样本采集仍建议采取即刻提取核酸或-20℃保存的方法.同时比较多种保存方法后发现,采用不同样...

关 键 词:肠道菌群  高通量测序  粪便  保存条件

Impact of temperature and time of storage on bacteria in fecal samples for metagenomic analyses
QIANG Yujun,HAN N,PENG Xianhui,ZHANG Tingting,LI Xiuwen,ZHANG Wen. Impact of temperature and time of storage on bacteria in fecal samples for metagenomic analyses[J]. Chinese Journal of Microecology, 2021, 33(6): 712-717
Authors:QIANG Yujun  HAN N  PENG Xianhui  ZHANG Tingting  LI Xiuwen  ZHANG Wen
Affiliation:State Key Laboratory for Infectious Disease Prevention and Control, National Institute for Communicable Disease Control and Prevention, Chinese Centre for Disease Control and Prevention, Beijing 102206, China
Abstract:
Keywords:Gut microbiota   Highthroughput sequencing technology   Fecal   Storage
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