番茄青枯病抗性相关miRNA的鉴定与表达分析

为理解番茄（Solanum lycopersicum）青枯病抗性响应miRNA与靶基因间的调控关系，对抗、感番茄自交系接种青枯菌（Ralstonia solanacearum）前后进行小RNA测序。结果在8个样本中共获得112.76 M高质量数据，检测到336个miRNA，包括193个新miRNA。其中，31个差异表达miRNA靶向调节575个基因的表达。556个靶基因被注释到防御反应、植病互作、植物激素信号转导等代谢途径中。启动子除典型的转录起始TATA-box和CAAT-box，及与生物胁迫相关的W-box和TC-rich repeats，还存在激素、光、非生物胁迫、伤等响应元件。RT-qPCR验证发现6对mi RNA-targets具有正-负、负-正和负-负3种番茄青枯病应答模式。这些结果初步揭示miRNA可以通过靶向基因表达响应番茄青枯病。