茶树CsTMFs的克隆与表达分析

基于茶树全基因组数据，筛选鉴定茶树（Camellia sinensis(L.)O. Ktze.）TATA元件调控因子（TATA element modulatory factor,TMF）CsTMFs家族成员。克隆茶树叶片中CsTMFs编码区序列（coding sequence,CDS）全长。使用生物信息学方法对CsTMFs的保守结构域、基因结构、理化性质、蛋白质二级结构和系统发育关系进行分析。基于转录组数据进行组织特异性表达的分析，利用实时荧光定量聚合酶链式反应（real-time fluorescent quantitative PCR,qPCR）方法检测冷胁迫和干旱胁迫下CsTMFs在茶树叶片中的表达情况。结果表明，CsTMFs家族有2个CsTMF基因，序列CDS区长度分别为2 934和2 904 bp，均具有TMF-DNA-bd和TMF-TATA-bd完整保守结构域。CsTMF1和CsTMF2具有组织表达特异性，CsTMF1在花与茎中表达较高，CsTMF2在成熟叶与茎中表达较高。CsTMF1受冷胁迫诱导，CsTMF2受冷胁迫和干旱胁迫抑制。