甘蓝型油菜每角果粒数全基因组关联分析 |
| |
作者姓名: | 肖小军 陈明 韩德鹏 余跑兰 郑伟 肖国滨 周庆红 周会汶 |
| |
作者单位: | 1. 江西农业大学农学院;2. 江西省红壤研究所/江西省红壤耕地保育重点实验室/国家红壤改良工程技术研究中心;3. 九江学院 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金项目(31860392,32260458);;国家油菜产业技术体系(CARS-12); |
| |
摘 要: | 为挖掘甘蓝型油菜每角果粒数显著关联单核苷酸多态性(SNP)位点及相关候选基因。本研究以300份甘蓝型油菜自交系为试验材料,对甘蓝油菜每角果粒数进行一年两地表型考察,并结合该群体前期开发的201 817个SNPs标记,采用一般线性模型(GLM)和混合线性模型(MLM)进行全基因组关联分析(GWAS),此外,对性状显著关联SNP位点两侧100 kb区域内相关候选基因进行功能预测。300份甘蓝型油菜每角果粒数在两地均表现出广泛的表型变异,筛选出2份每角果粒数较多的油菜种质资源。基于GLM模型检测到39个与油菜每角果粒数显著关联SNPs,采用MLM分析发现,两地共检测到的3个每角果粒数显著关联SNPs位点均在GLM检测到。8个位点附近找到CIK,ERF022和EDE1等19个拟南芥已报道角果籽粒发育相关的同源基因。研究结果有助于解析甘蓝型油菜每角果粒数的遗传基础,为研究每角果粒数的调控机制、指导每角果粒数的遗传改良奠定基础。
|
关 键 词: | 甘蓝型油菜 全基因组关联分析 每角果粒数 SNP位点 同源基因 |
|