| 河南省猪戊型肝炎病毒HN-JY40的全基因组序列测定及分析 |
| |
| 引用本文： | 张小霞,张亲,梁振普,许锋,邵新峰.河南省猪戊型肝炎病毒HN-JY40的全基因组序列测定及分析[J].病毒学报,2015,31(3). |
| |
| 作者姓名： | 张小霞 张亲 梁振普 许锋 邵新峰 |
| |
| 作者单位： | 河南农业大学 生命科学学院,郑州,450002;河南农业大学 生命科学学院,郑州,450002;河南农业大学 生命科学学院,郑州,450002;河南农业大学 生命科学学院,郑州,450002;河南农业大学 生命科学学院,郑州,450002 |
| |
| 摘 要： | 本文旨在测定猪戊型肝炎病毒HN-JY40株的全基因组序列,并对其序列特征和进化关系进行分析。设计8对引物,利用RT-PCR、3′RACE和5′RACE技术得到了戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)河南分离株HNJY40的近似全基因组序列,命名为"HN-JY40";用Expasy、Megalign、Clustal X和MEGA 4等生物学软件进行序列分析、同源比对和进化树的构建。测序得到的HN-JY40序列去除polyA后全长7 223bp,5′UTR有9个碱基,3′UTR全长69bp。ORF1(5 124bp)编码1 707个氨基酸,ORF2(2 025bp)编码674个氨基酸,ORF3(345bp)编码114个氨基酸。全基因组相似性分析发现,HN-JY40为典型的基因4型病毒,且属于一个新亚型。猪HN-JY40ORF1的部分核苷酸(153~432bp)与人源HK104-2004同源性高达到96%,为揭示戊型肝炎的跨种传播提供了新的分子生物学依据。
|
| 关 键 词： | 猪戊型肝炎病毒HN-JY40 RT-PCR 3’RACE 5’RACE 序列分析 同源性 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
