| 组分距离方法构建基于核糖体蛋白质或氨酰tRNA合成酶的原核生物亲缘树 |
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| 引用本文： | 卫海滨,戚继,郝柏林.组分距离方法构建基于核糖体蛋白质或氨酰tRNA合成酶的原核生物亲缘树[J].中国科学C辑,2004,34(2):186-194. |
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| 作者姓名： | 卫海滨 戚继 郝柏林 |
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| 作者单位： | 1. 浙江大学生命科学学院,杭州,310027;中国科学院北京基因组研究所杭州分部,杭州,310008
2. 复旦大学理论生命科学研究中心,上海,200433;中国科学院理论物理研究所,北京,100080
3. 中国科学院北京基因组研究所杭州分部,杭州,310008;复旦大学理论生命科学研究中心,上海,200433 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究项目(批准号: G2000077308)，国家自然科学基金(批准号: 30170232)，中国科学院创新工程资助项目，上海市通过复旦大学的资助 |
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| 摘 要： | 最近新发展的基于计算短串频度, 推断原核生物系统发生关系的K串组分距离方法, 以整个蛋白质组作为数据集. 采用每个物种的全部核糖体蛋白质或氨酰tRNA合成酶, 得到一致结果. 已知后一组蛋白质在单个使用时, 产生彼此不同的进化树. 我们构建进化树不需做任何序列联配, 所得亲缘树包括16个古细菌、105个细菌和2个真核生物. 大部分低层分支与《伯杰系统细菌学手册》(第2版), 即2003年第4次发布的细菌系统分类大纲相一致, 而且对高层分支关系给出一些建议.
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| 关 键 词： | 古细菌 系统发生 系统发生树 组分距离 原核生物 |
| 收稿时间： | 2003-11-24 |
| 修稿时间： | 2003年11月24 |
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