| 食蟹猴MHC I类A型新等位基因序列分析 |
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| 引用本文： | 黄上洺,凌飞,蒋琼橙,卓敏. 食蟹猴MHC I类A型新等位基因序列分析[J]. 中国生物工程杂志, 2010, 30(5): 43-48 |
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| 作者姓名： | 黄上洺 凌飞 蒋琼橙 卓敏 |
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| 作者单位： | 华南理工大学生物科学与工程学院 广州 510006 |
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| 基金项目： | 国家"973"重点基础研究规划项目子项目，广东省自然科学基金博士启动基金 |
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| 摘 要： | 采用自行设计的MHC I类A型基因的引物从10只食蟹猴扩增得到11个3 000bp左右MHC等位基因。通过在Blast比对之后，证实有7个Mafa-A等位基因，4个Mafa-AG等位基因，新的等位基因序列已递交GenBank。由于每个个体可以检测出多个不同的Mafa-A等位基因，这说明食蟹猴Mafa-A基因经过多次复制，并且推测Mafa-AG是Mafa-A衍生物。同时，研究了等位基因在个体中的分布和系统进化树分析。
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| 关 键 词： | 食蟹猴 主要组织相容性复合体 系统进化树 |
| 收稿时间： | 2010-01-25 |
| 修稿时间： | 2010-03-04 |
Sequence Analysis of Macaca fascicularis's New MHC I-A Alleles |
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| HUANG Shang-ming,LING Fei,JIANG Qiong-cheng,ZHUO Min. Sequence Analysis of Macaca fascicularis's New MHC I-A Alleles[J]. China Biotechnology, 2010, 30(5): 43-48 |
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| Authors: | HUANG Shang-ming LING Fei JIANG Qiong-cheng ZHUO Min |
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| Affiliation: | School of Bioscience and Bioengineering, South China University of Technology, Guangzhou 510006, China |
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| Abstract: | Elevent's MHC class I alleles around 3000bp have been identified from 10 Macaca fascicularis. BLAST analysis showed that the novel alleles include 7 Mafa-A alleles and 4 Mafa-AG alleles, which had been submitted to GenBank. Different Mafa-A alleles have been identified in each sample, it can be inferred that Mafa-A alleles have been duplicated and Mafa-AG alleles are derivative of Mafa-A alleles. Based on the new alleles, we analyze the alleles distribution among the samples and the phylogenetic tree. |
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| Keywords: | Macaca fascicularis MHC Phylogenetic tree |
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