| 一个基于基因表达谱的基因逻辑网络模型的建立与应用 |
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| 引用本文： | 阮晓钢,王金莲,李辉.一个基于基因表达谱的基因逻辑网络模型的建立与应用[J].生物化学与生物物理进展,2007,34(8):871-880. |
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| 作者姓名： | 阮晓钢 王金莲 李辉 |
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| 作者单位： | 1. 北京工业大学电子信息与控制工程学院,北京,100022
2. 北京工业大学计算机学院,北京,100022 |
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| 摘 要： | 基因之间除了线性关联作用关系外,还存在着非线性的逻辑关系.用这种逻辑关系构建的生物系统网络模型对研究细胞内的各种生物通路和细胞分子网络非常重要.首先,根据图着色原理确定了基因的低阶和高阶逻辑关系,然后应用结肠癌基因表达谱数据分析了51个癌基因和抑癌基因的逻辑关系,在此基础上构建了结肠癌基因表达的逻辑网络.通过这个网络模型发现了与KEGG数据库中结肠癌通路一致的转化生长因子信号通路,并分析了各生物通路成员之间错综复杂的关系.实验结果表明,基因逻辑网络模型在一定程度上揭示了结肠癌基因和抑癌基因之间并行、分叉等复杂的相互作用关系,反映了结肠癌发病的复杂分子机制,为分子生物医学家提供了一个参考模型.
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| 关 键 词： | 结肠癌 基因表达谱 基因网络 图着色 |
| 收稿时间： | 2007/1/23 0:00:00 |
| 修稿时间： | 3/8/2007 12:00:00 AM |
Modeling Colon Cancer Gene Logic Network With mRNA Microarray Data |
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| RUAN Xiao-Gang,WANG Jin-Lian and LI Hui.Modeling Colon Cancer Gene Logic Network With mRNA Microarray Data[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2007,34(8):871-880. |
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| Authors: | RUAN Xiao-Gang WANG Jin-Lian and LI Hui |
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| Institution: | College of Electronic Information and Control Engineering, Beijing University of Technology, Beijing 100022, China;College of Electronic Information and Control Engineering, Beijing University of Technology, Beijing 100022, China;College of Computer Science and Technology, Bejing University of Technology, Beijing 100022, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | colon cancer mRNA microarray gene network graph coloring |
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