| 基于转录组测序的铁皮石斛植物甾醇生物合成相关基因分析 |
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| 引用本文： | 林江波,王伟英,邹晖,戴艺民. 基于转录组测序的铁皮石斛植物甾醇生物合成相关基因分析[J]. 热带亚热带植物学报, 2019, 27(6): 693-701 |
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| 作者姓名： | 林江波 王伟英 邹晖 戴艺民 |
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| 作者单位： | 福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建 漳州 363005,福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建 漳州 363005,福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建 漳州 363005,福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建 漳州 363005 |
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| 基金项目： | 福建省自然科学基金面上项目（2018J01119）资助 |
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| 摘 要： | 为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)植物甾醇的生物合成途径,利用Illumina HiSeq 4000高通量测序技术对茎和叶进行转录组测序,比较植物甾醇生物合成关键酶基因的表达。结果表明,共获得43 085条Unigenes,其中24 459条在Nr、Swiss-prot、KOG和KEGG数据库获得注释,7 333条获得共同注释。KEGG代谢途径分析表明,铁皮石斛植物甾醇生物合成分为3个阶段,共有50个Unigenes (30种酶)参与。表达分析表明,DXR和HMED的表达量明显高于MK和MVD;成熟期茎、叶SMT1的表达量比生长期高,SMT2则生长期高于成熟期;同一时期,SMT1和SMT2在叶的表达量都比茎高。这为铁皮石斛植物甾醇的开发利用和调控植物甾醇生物合成研究提供了科学依据。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 高通量测序 植物甾醇 基因 表达 代谢 |
| 收稿时间： | 2018-12-03 |
| 修稿时间： | 2019-03-04 |
Analysis of Related Genes in Phytosterol Biosynthesis in Dendrobium officinale Based on Transcriptome Sequencing Technology |
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| LIN Jiang-bo,WANG Wei-ying,ZOU Hui and DAI Yi-min. Analysis of Related Genes in Phytosterol Biosynthesis in Dendrobium officinale Based on Transcriptome Sequencing Technology[J]. Journal of Tropical and Subtropical Botany, 2019, 27(6): 693-701 |
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| Authors: | LIN Jiang-bo WANG Wei-ying ZOU Hui DAI Yi-min |
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| Affiliation: | Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China,Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China,Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China and Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale High-throughput sequencing Phytosterol Gene Expression Metabolism |
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