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| 基于密码子偏性的置换模型估计正向选择 | |
| 引用本文： | 张丽丽,刘心声.基于密码子偏性的置换模型估计正向选择[J].生物数学学报,2014(2):297-302. |
| 作者姓名： | 张丽丽 刘心声 |
| 作者单位： | 南京航空航天大学航空宇航学院理学院 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(61374183,10971097) |
| 摘 要： | 由于遗传密码子的简并性特征,大多氨基酸由多于一种密码子编码.在蛋白质编码过程中,同义密码子间的使用有着较显著的偏差,即同义密码于使用频率不等.应用CUSP软件对数据集H3N2和MHC进行同义密码子使用偏性的分析,然后基于同义密码子的使用偏性建立新的密码子置换模型,并在此模型的基础上分析物种的正向选择性.分析结果表明新的密码子置换模型能更好地拟合数据,由此可得到更加可靠的参数估计值. |
| 关 键 词： | 极大似然估计 密码子置换模型 密码子使用偏性 正向选择 |
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