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重建系统演化树的一种新方法--试错法
引用本文:谭远德. 重建系统演化树的一种新方法--试错法[J]. 动物学报, 2000, 46(4): 448-456
作者姓名:谭远德
作者单位:湖南师范大学生命科学学院, 长沙 410081
摘    要:重建系统演化树是进化研究的一个极为重要的方面。系统树的构建依赖于一定的方法和数据。在分子系统演化研究中,所使用的数据大多是DNA序列、氨基酸序列和分子标记。而就构树方法来说,NJ法、ML法和MP法是三种最为普遍使用的方法。本文给出了一种新的建树方法,即试错法。该方法不但具有与NJ法一样好的建树效果,而且不存在难以解释的负枝长问题。

关 键 词:系统演化树 分子进化 DNA序列 氨基酸序列

A NEW METHOD FOR RECONSTRUCTION OF PHYLOGENETICTREE:TRIAL ERROR METHOD
TAN YuanDe. A NEW METHOD FOR RECONSTRUCTION OF PHYLOGENETICTREE:TRIAL ERROR METHOD[J]. Acta Zoologica Sinica, 2000, 46(4): 448-456
Authors:TAN YuanDe
Abstract:Reconstruction of phylogenetic tree of organisms is one of the most important problems in evolution study.Reconstruction of phylogenetic tree depends upon treemaking method and data set.The majority of data set used in molecular phylogenetic research comes from DNA and amino acid sequences and sometimes also molecular markers.As for treemaking methods,there are many treemaking methods,of which the NJ,ML,and MP methods are the most popular methods uded.In this paper,we proposed a new tree making method,called trial error(TE) method.This method not only has the same efficiency of producing trees as the NJ method but also does not produce the negative branch length in tree. Like the NJ tree, the TE tree is also an unrooted tree.
Keywords:Phylogenetic tree   Molecular evolution   DNA sequences   Amino acid sequence
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