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江口萝卜猪FABPs主要家族基因SNPs筛选及生物信息学分析
作者姓名:盘道兴  王振  杨茂林  廖乔平  杨昌平  吴宇萍  谢海强  刘若余
作者单位:贵州大学动物科学学院;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室;贵州省江口县科技局;贵州省江口县畜牧局
基金项目:贵州省农业攻关(黔科合NY(2014)3045号);贵州省科技富民强县项目(黔科合县市科技计划(2012)7024号)共同资助
摘    要:以江口萝卜猪为试验材料构建DNA池,采用直接测序技术对猪L-FABP、I-FABP、H-FABP、A-FABP基因进行SNPs快速筛查,共检测出7个SNPs,分别为intron1-T1745C、exon2-T125C、exon2-A131C、exon2-C153A、exon2-A65T、exon2-G40A、intron3-C65T。其中intron1-T1745C、intron3-C65T位于内含子上;exon2-T125C、exon2-C153A为同义突变;exon2-A131C、exon2-A65T、exon2-G40A为错义突变,分别使编码氨基酸发生Glu→Ala、Lys→Met、Glu→Lys的改变,对其进行生物信息学分析表明,突变前后的等位基因频率估算,mR NA二级结构预测,蛋白质二级、三级结构预测分析均有差异。

关 键 词:江口萝卜猪  脂肪酸结合蛋白基因  SNPs  生物信息学
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