森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆 |
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引用本文: | 周厚成,;李刚,;赵霞,;康兆茹,;郭蔼光.森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆[J].植物生理学通讯,2014(11):1630-1638. |
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作者姓名: | 周厚成 ;李刚 ;赵霞 ;康兆茹 ;郭蔼光 |
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作者单位: | [1]中国农业科学院郑州果树研究所,郑州450009; [2]西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100 |
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基金项目: | 河南省基础与前沿技术项目(132300410034);公益性行业(农业)科研专项(201003064-7) |
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摘 要: | 本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragaria vesca)基因组数据库中MADS-box基因的数量、结构类型、序列特征及染色体定位进行分析。结果表明,获得70个含SRF-TF结构域的森林草莓Fv MADS基因,DNA长度289~14 596 bp,编码66~1 437个氨基酸残基,有21个Fv MADS没有内含子,在7条染色体上呈不均匀分布;68个Fv MADS蛋白序列含有保守基序Motif 1,最佳匹配序列为"RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF"。另外,从栽培品种‘丰香’草莓果实中克隆了Fa MADS1基因,该基因属于MADS-box基因家族,c DNA全长1 167 bp,编码区750 bp,推导编码249个氨基酸,具有MADS结构域和K-box结构域。
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关 键 词: | 草莓 MADS-box 转录因子 生物信息学 FaMADS1基因 |
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