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分子表面的计算机表示
引用本文:蔡文生,邵学广,潘忠孝,张懋森. 分子表面的计算机表示[J]. 生物化学与生物物理进展, 1998, 25(4): 355-359
作者姓名:蔡文生  邵学广  潘忠孝  张懋森
作者单位:中国科学技术大学应用化学系, 合肥 230026;中国科学技术大学化学系,合肥 230026;中国科学技术大学应用化学系, 合肥 230026;中国科学技术大学应用化学系, 合肥 230026
基金项目:中国科学院和国家教委留学回国人员科研资助费资助项目.
摘    要:提出了一种用于生成分子光滑表面的新算法.该算法从分布在一个包含整个分子表面的椭球上的三角网络开始,逐步收缩网络直到所有的三角形最佳贴近分子表面.所使用的收缩包络椭球的技术只要稍加修改就可用于蛋白质空腔的表示.

关 键 词:分子表面,表面积,体积,分子图形,分子识别
收稿时间:1997-05-27
修稿时间:1997-09-15

Representation for the Molecular Surface
CAI Wen-sheng,SHAO Xue-guang,PAN Zhong-xiao and ZHANG Mao-Sen. Representation for the Molecular Surface[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 1998, 25(4): 355-359
Authors:CAI Wen-sheng  SHAO Xue-guang  PAN Zhong-xiao  ZHANG Mao-Sen
Affiliation:Department of Applied Chemisty, University of Science and Technology of China, Hefei 230026, China;Department of Chemistry, University of Science and Technology of China, Hefei 230026, China;Department of Applied Chemisty, University of Science and Technology of China, Hefei 230026, China;Department of Applied Chemisty, University of Science and Technology of China, Hefei 230026, China
Abstract:A new method for the representation of smooth molecular surface was proposed. The embracing surface, which started from a triangular mesh built on an ellipsoid embracing the whole molecular surface, is deflated stepwise until all the triangles will stick the surface of the molecule. This method can be easily used to get the cavity of the protein.
Keywords:molecular surface   surface area   volume   molecular graphics   molecular recognition
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