| 荷包猪一类缺失型SLA-3等位基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 乔翠,许崇波,张兴会,张文军,郭丹,张胜,高凤山.荷包猪一类缺失型SLA-3等位基因的克隆及生物信息学分析[J].生物技术通报,2012,0(9):87-93. |
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| 作者姓名： | 乔翠 许崇波 张兴会 张文军 郭丹 张胜 高凤山 |
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| 作者单位： | 1. 大连大学生物工程学院生物化学和分子生物学实验室,大连,116622
2. 辽宁省畜牧科学研究院,辽阳,111000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，辽宁省博士启动基金，辽宁省教育厅科学计划项目 |
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| 摘 要： | 为研究荷包猪SLA-3基因特征,设计引物克隆了荷包猪SLA-3,经生物信息学软件分析其基因特征。结果显示,所克隆的荷包猪SLA-3基因(暂命名为SLA-3-HB02)碱基序列长度为1 417 bp,其中2-1 054为ORF区,共编码350个氨基酸,在其编码的氨基酸334-344处存在缺失。SLA-3-HB02与其他SLA-3、SLA-2及SLA-1等位基因群的氨基酸同源率分别为87.8%-98.6%、82.8%-87.8%和83.7%-90.0%。分子进化关系分析,SLA-3-HB02与美国的Hanford遗传距离较近;各功能区分析,SLA-3-HB02保留了HLA-A2等的部分功能基因位点,并与HLA-B15和H-2K1有一定的交叉识别位点。同源模建揭示SLA-3-HB02分子与HLA-A2及H-2K1 3D结构相似。
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| 关 键 词： | 荷包猪 SLA-3基因 缺失型 等位基因 生物信息学 |
Cloning and Analyzing a Deleted Type of SLA-3 Allele in Hebao Pigs by Bioinformatics |
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| Qiao Cui
,
Xu Chongbo
,
Zhang Xinghui
,
Zhang Wenjun
,
Guo Dan
,
Zhang Sheng
,
Gao Fengshan.Cloning and Analyzing a Deleted Type of SLA-3 Allele in Hebao Pigs by Bioinformatics[J].Biotechnology Bulletin,2012,0(9):87-93. |
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| Authors: | Qiao Cui Xu Chongbo Zhang Xinghui Zhang Wenjun Guo Dan Zhang Sheng Gao Fengshan |
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| Institution: | 1(1 Laboratory of Biochemistry and Molecular Biology,College of Life Science and Technology in Dalian University,Dalian 116622;2 Institute of Animal Husbandry of Liaoning Province,Liaoyang 111000) |
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| Abstract: | |
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