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一种优化的胡杨高效多重(12重)SSR体系
作者姓名:徐放  赵舒  邬荣领  杜芳
作者单位:北京林业大学计算生物学中心、林木遗传育种国家工程实验室、生物科学与技术学院,北京100083
基金项目:Doctoral Program of Higher Education of China ( 2011DD 14120014 ) and Fundamental Research Funds for the Central Universities (TD 2012-01) to FKD
摘    要:微卫星多重PCR方法是一种非常经济并且高通量的基因分型技术。本研究在耐干旱、盐碱的胡杨(Populus euphratica)中开发出一套荧光标记的12重微卫星工作体系。该体系包含12条表达序列标签微卫星(EST-SSR)引物,其中3条设计于NCBI,另外9条设计于二代的转录组序列。利用该多重微卫星体系可在单一的PCR反应体系中成功扩增出12条表达序列标签的微卫星短序列片段。并在胡杨的3个自然居群96个个体中对该体系进行了验证,结果显示该体系具有很高的稳定性及多样性。同时,在杨属的5个派7个种中对其通用性进行了检验,显示这些引物具有很高的通用性,成功扩增率为79%。本研究中提供的12重多重PCR结合本实验已经公开发表的2个8重体系对揭示胡杨及其他杨树的进化历史具有重要的作用。最后,本研究认为引物的选择,扩增效率,哑等位基因的检测是多重体系开发过程中最为关键的步骤。

关 键 词:胡杨  多重PCR  基因分型
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