| 利用分散量理论辨识外膜蛋白 |
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| 引用本文： | 邹凌云,王正志,黄教民.利用分散量理论辨识外膜蛋白[J].生命科学研究,2008,12(4). |
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| 作者姓名： | 邹凌云 王正志 黄教民 |
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| 作者单位： | 国防科技大学,机电工程与自动化学院,中国湖南,长沙,410073 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目
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| 摘 要： | 利用分散量的数学理论,提出了基于最小分散增量的蛋白质序列辨识方法.通过多种特征联合对蛋白质序列进行编码,并建立基于最小分散增量的分类器MID_OMP,应用于革兰氏阴性细菌外膜蛋白序列辨识.在数据集上的Jackknife测试中,MID_OMP辨识外膜蛋白和α螺旋跨膜蛋白的准确率达到95.7%,辨识外膜蛋白和球状蛋白的准确率达到91.0%;在14个细菌基因组内挖掘结果显示,MID_OMP具有较高的敏感性和特异性,预测结果的可信度明显优于另外一种OMPs挖掘工具TMBETA-GENOME.
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| 关 键 词： | 外膜蛋白 分散量 分散增量 挖掘 |
Discrimination of Outer Membrane Proteins Using Measures of Diversity |
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| ZOU Ling-yun,WANG Zheng-zhi,HUANG Jiao-min.Discrimination of Outer Membrane Proteins Using Measures of Diversity[J].Life Science Research,2008,12(4). |
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| Authors: | ZOU Ling-yun WANG Zheng-zhi HUANG Jiao-min |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | outer membrane proteins measure of diversity increment of diversity mining |
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