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按蚊防御素基因家族转录模式和启动子的生物信息学分析
引用本文:刘红美,吴建伟. 按蚊防御素基因家族转录模式和启动子的生物信息学分析[J]. 生物信息学, 2008, 6(3): 109-112
作者姓名:刘红美  吴建伟
作者单位:1. 贵阳医学院医学生物技术教研室,贵州,贵阳,550004
2. 贵阳医学院寄生虫学教研室,贵州,贵阳,550004
基金项目:贵州省优秀科技教育人才省长基金,贵州省高层次人才基金,贵阳医学院博士启动经费 
摘    要:运用生物信息学方法分析冈比亚按(Anopheles gambiae)中防御素基因家族的表达模式和启动子保守区。在ENSEMBL数据库中搜索防御素基因家族序列,然后将基因编号输入angaGEDUCI数据库中进行分析。结果在冈比亚按蚊中存在有4个防御素基因的异构体分子,其中DEF1基因表达模式与其它3个基因存在明显差异。4个防御素基因启动子序列都存在AP-1、GATA-1、GCN4、GR、HNF-3B、TFIID6个转录因子的识别结合位点,表明这6个转录因子是冈比亚按蚊防御素基因家族表达调控所必需的。值得注意的是,DEF1基因启动子序列中存在与性别决定翦关的SOXproteins转录因子的结合位点,暗示DEF1基因的转录调控可能与性别分化有关;而在DEF2基因启动子序列中存在有热激因子(HSTF)的识别结合位点,表明热刺激会调控DEF2基因的表达。

关 键 词:防御素  冈比亚按蚊  转录模式  转录因子

Transcriptional model and promoter analysis of the defensins gene family in Anopheles gambiae by computer
LIU Hong-mei,WU Jian-wei. Transcriptional model and promoter analysis of the defensins gene family in Anopheles gambiae by computer[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2008, 6(3): 109-112
Authors:LIU Hong-mei  WU Jian-wei
Affiliation:LIU Hong - mei , WU Jian - wei ( 1. The department of Biotechnology in Guiyang Medical College, Guiyang Guizhou 550004, China ; 2. The department of Parasitology in Guiyang Medical College, Guiyang Guizhou 550004, China)
Abstract:
Keywords:
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