| 西伯利亚蓼几丁质酶基因Class Ⅳ的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘关君,刘昌财,刘明坤,魏志刚,刘桂丰. 西伯利亚蓼几丁质酶基因Class Ⅳ的克隆及生物信息学分析[J]. 植物生理学通讯, 2008, 44(3) |
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| 作者姓名： | 刘关君 刘昌财 刘明坤 魏志刚 刘桂丰 |
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| 作者单位： | 1. 林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室,东北林业大学,哈尔滨,150040
2. 林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室,东北林业大学,哈尔滨,150040;中国人民解放军61699部队,湖北枝江,443200 |
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| 摘 要： | 根据西伯利亚蓼抑制消减文库（SSH）中获得的几丁质酶（CHI）基因的部分序列，采用RACE技术克隆了具完整编码区的cDNA序列，基因全长1017bp，开放阅读框编码270个氨基酸。序列分析表明，该基因的编码蛋白（PsCHI1）以前体形式存在，N端分别有22个氨基酸的信号肽和35个氨基酸的几丁质结合域（CBD），C端199个氨基酸为催化区（CD），连接CBD与CD的14个氨基酸为可变交联区，成熟蛋白为不含信号肽部分，呈碱性，带正电荷。PsCHI1与所选其它植物classⅣCHI前体序列具有高度的同源性（53％-69％），而与classⅠ和classⅡCHI的氨基酸序列同源性较低，推测为植物classⅣCHI。根据日本水稻CHI晶体结构构建了PsCHI1三维分子模型，分析显示PsCHI1可以识别比classⅠ和classⅡCHI短的几丁质片段，并以其它植物CHI的已知结构域和功能为基础，确定PsCHI1具有能够水解真菌细胞壁的结构，推测其可能有抗病原微生物的功能。
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| 关 键 词： | 西伯利亚蓼 几丁质酶(CHI) RACE GPI锚 西伯利亚蓼 几丁质 酶基因 Class 克隆 生物信息学分析 Chitinase Gene Analysis Bioinformatics 抗病原微生物 结构域 真菌细胞壁 功能 识别 显示 分子模型 三维 晶体结构 水稻 日本 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of Class IV Chitinase Gene from Polygonum sibiricum Laxm |
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| LIU Guan-Jun,LIU Chang-Cai,LIU Ming-Kun,WEI Zhi-Gang,LIU Gui-Feng. Cloning and Bioinformatics Analysis of Class IV Chitinase Gene from Polygonum sibiricum Laxm[J]. Plant Physiology Communications, 2008, 44(3) |
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| Authors: | LIU Guan-Jun LIU Chang-Cai LIU Ming-Kun WEI Zhi-Gang LIU Gui-Feng |
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