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新疆猪粪便戊型肝炎病毒RNA的检测及序列分析
引用本文:马勋,陆承平.新疆猪粪便戊型肝炎病毒RNA的检测及序列分析[J].Virologica Sinica,2004,19(4):360-363.
作者姓名:马勋  陆承平
作者单位:南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室 江苏南京210095 (马勋),南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室 江苏南京210095(陆承平)
摘    要:从戊型肝炎病毒(Hepatitis Evirus,HEV)IgG检测阳性的新疆某猪场采集70份猪粪便,利用逆转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测HEV RNA,其中13份为阳性,阳性率18.57%。将PCR扩增产物克隆到pMD18-T载体上,构建成重组质粒并测序,结果表明,13株猪源HEV分离株在HEV ORF2 348bp核苷酸序列的同源性为97.1%~100%,为同一基因型;与HEVⅠ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ的同源性分别为74.1%-77.6%,71.6%-74.1%,73.3%~78.2%和82.8%-91.4%,与ⅣA亚型的同源性同源性最高达89.4%-91.4%。以该核苷酸片段绘制的基因进化树显示13株猪源HEV与HEV Ⅳ T1株在同一分支上,属基因Ⅳ型;与国内其他猪源HEV分离株该片段核苷酸序列的同源性为82.6%-91.3%,提示中国猪源HEV的基因型比较一致,同属HEV Ⅳ型。

关 键 词:戊型肝炎病毒  RNA  序列分析  基因型    粪便

Detection and Analysis of Partial Sequences of Swine Hepatitis E Virus in Xinjiang
MA Xun,LU Cheng-ping.Detection and Analysis of Partial Sequences of Swine Hepatitis E Virus in Xinjiang[J].中国病毒学(英文版),2004,19(4):360-363.
Authors:MA Xun  LU Cheng-ping
Institution:MA Xun,LU Cheng-ping**
Abstract:
Keywords:
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