| 癌相关通路在肺腺癌中的共扰动机制 |
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| 引用本文： | 朱晶,沈晓沛,肖会,张杨,王靖,郭政. 癌相关通路在肺腺癌中的共扰动机制[J]. 生物信息学, 2010, 8(4): 291-294 |
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| 作者姓名： | 朱晶 沈晓沛 肖会 张杨 王靖 郭政 |
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| 作者单位： | 1. 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心,成都,610054
2. 电子科技大学生命科学与技术学院生物信息学中心,成都,610054;哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,哈尔滨,150086 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金30670539,国家自然科学基金30770558 |
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| 摘 要： | 肺腺癌的发生涉及多个生物学功能通路的扰动,其遗传改变频繁地发生于MAPK信号、p53信号、Wnt信号、细胞周期和mTOR等通路的基因中。解析癌相关通路间的共扰动机制对我们理解癌机制以及寻找诊断标记具有重要意义。因此,本文基于肺腺癌突变谱数据,研究上述癌相关通路在肺腺癌中的共扰动机制。结果发现:在肺腺癌发生的过程中,MAPK信号、p53信号、Wnt信号、细胞周期和mTOR等通路同时被扰动。在不同的癌样本中,一对通路可能通过以下三种方式被共同扰动:(1)在两条通路中的不同基因间的共突变;(2)两条通路相互交叠基因的突变;(3)与两条通路同时具有频繁的互作关系的蛋白质的编码基因的突变。该结果提示,癌相关通路对在不同的样本中可能通过不同的方式被共扰动,这也可能是造成癌症异质性的重要原因之一。
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| 关 键 词： | 肺腺癌 基因突变 信号通路 蛋白质互相作用 |
The co-dysregulations of cancer related pathways in lung adenocarcinoma |
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| ZHU Jing,SHEN Xiao-pei,XIAO Hui,ZHANG Yang,WANG Jing,GUO Zheng. The co-dysregulations of cancer related pathways in lung adenocarcinoma[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2010, 8(4): 291-294 |
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| Authors: | ZHU Jing SHEN Xiao-pei XIAO Hui ZHANG Yang WANG Jing GUO Zheng |
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| Affiliation: | ZHU Jing1,SHEN Xiao-pei1,XIAO Hui1,ZHANG Yang1,WANG Jing1,GUO Zheng1,2(1.Bioinformatics Centre,School of Life Science,University of Electronic Science and Technology of China,Chengdu 610054,China,2.School of Bioinformatics Science and Technology,Harbin Medical University,Harbin 150086,China) |
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| Abstract: | The initiation of lung adenocarcinoma involves the disruption of multiple functional pathways.The mutation frequently happened to the gene in MAPK,p53,Wnt cell cycle and mTOR signal pathway etc.The analysis of co-dysregulations of cancer related pathways plays an important role for us to understand the mechanism of cancer and find markers.Based on the somatic mutation data of lung adenocarcinoma,we studied the co-dysregulations of cancer related pathways.Our results show that during the process of lung aden... |
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| Keywords: | lung adenocarcinoma mutation profile signaling pathway protein-protein interaction |
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