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抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究
引用本文:杨洁,刘次全. 抑制启动子的三链DNA的结构模建及稳定性研究[J]. 生物化学与生物物理进展, 2000, 27(3): 283-286
作者姓名:杨洁  刘次全
作者单位:中国科学院昆明动物研究所,昆明,650223
基金项目:国家自然科学基金资助项目(39770418).
摘    要:在IRIS Indigo2(SGI公司)工作站上,利用InsightⅡ/MSI软件包,以TAT三链DNA为模板,采用同源模建的方法,分别建立起两个含21nt的脱氧寡核苷酸CP1(G3TG2TGT2G5TG2TGT)和CP3(TGTG2TG5T2GTG2TG3)的三维结构.采用分子力学方法进行能量优化,将得到的能量最低结构作为分子的优势构象.研究结果显示,CP1的能量低于CP3的能量,即前者的结构较后者稳定.从而证明了CP1与乙肝病毒(HBV)的核心启动子(Cp)片段之间能稳定地形成三链DNA,并能特异性地抑制DNA结合蛋白与Cp片段的结合.这些结果表明,三链DNA的形成有可能抑制DNA的转录.

关 键 词:三链DNA,反基因策略,同源模建,核心启动子   乙肝病毒(HBV)
收稿时间:1999-02-13
修稿时间::

Stability and Molecular Modeling of Triplex DNA Inhibiting DNA Binding Protein Binding to the Core Promoter of Hepatitis B Virus
YANG Jie and LIU Ci-Quan. Stability and Molecular Modeling of Triplex DNA Inhibiting DNA Binding Protein Binding to the Core Promoter of Hepatitis B Virus[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 2000, 27(3): 283-286
Authors:YANG Jie and LIU Ci-Quan
Affiliation:Kunming Institute of Zoology, The Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China;Kunming Institute of Zoology, The Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223, China
Abstract:
Keywords:triplex DNA   antigene strategy   homology modeling   core promoter   hepatitis B virus (HBV)
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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