杜仲雄花芽2个发育时期转录组分析 |
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引用本文: | 朱利利,杜庆鑫,何凤,庆军,杜红岩.杜仲雄花芽2个发育时期转录组分析[J].植物研究,2020,40(2):284-292. |
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作者姓名: | 朱利利 杜庆鑫 何凤 庆军 杜红岩 |
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作者单位: | 1. 中国林业科学研究院经济林研究开发中心, 郑州 450003;2. 国家林业局杜仲工程技术研究中心, 郑州 450003 |
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基金项目: | "十三五"国家重点研发计划(2017YFD0600702)。 |
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摘 要: | 杜仲(Eucommia ulmoides)雄花富含多种活性成分和营养成分,具有重要的药用和营养价值。为了揭示杜仲雄蕊原基发育相关基因的表达情况,为杜仲雄花芽发育分子调控机制研究提供理论参考。本文以杜仲良种"华仲11号"( "Huazhong No.11" )为材料,采用lllumina高通量测序技术,分别对苞叶原基分化期和雄蕊原基分化期的花芽进行转录组测序,通过生物信息学对2个发育时期的转录组进行比较分析,筛选出与雄花芽形态发育相关的差异基因。结果显示,转录组测序共获得40.48 Gb过滤数据,各样品的clean reads与杜仲基因组进行序列比对,比对效率为90.56%~93.01%。在2个发育时期筛选出583个差异表达基因,其中在雄蕊原基发育期上调基因315个,下调基因267个。差异基因GO和KEGG功能分析显示,差异基因富集在与生长发育、光周期途径、激素合成和信号传导、碳代谢等相关的生物过程和代谢通路。结果显示光周期途径是杜仲成花诱导的重要途径,同时雄花芽在形态分化过程中受碳水化合物、植物激素和其他代谢物质调控。此外,MADS-box家族成员FLC、SOC1、AGL3和AGL8参与杜仲雄蕊器官发育。本研究为杜仲花发育基因调控提供了基础数据,也为雄花用杜仲的分子育种提供了参考。
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关 键 词: | 杜仲 雄花芽 不同发育时期 转录组测序 差异表达基因 |
收稿时间: | 2019-03-18 |
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