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杜仲雄花芽2个发育时期转录组分析
引用本文:朱利利,杜庆鑫,何凤,庆军,杜红岩.杜仲雄花芽2个发育时期转录组分析[J].植物研究,2020,40(2):284-292.
作者姓名:朱利利  杜庆鑫  何凤  庆军  杜红岩
作者单位:1. 中国林业科学研究院经济林研究开发中心, 郑州 450003;2. 国家林业局杜仲工程技术研究中心, 郑州 450003
基金项目:"十三五"国家重点研发计划(2017YFD0600702)。
摘    要:杜仲(Eucommia ulmoides)雄花富含多种活性成分和营养成分,具有重要的药用和营养价值。为了揭示杜仲雄蕊原基发育相关基因的表达情况,为杜仲雄花芽发育分子调控机制研究提供理论参考。本文以杜仲良种"华仲11号"( "Huazhong No.11" )为材料,采用lllumina高通量测序技术,分别对苞叶原基分化期和雄蕊原基分化期的花芽进行转录组测序,通过生物信息学对2个发育时期的转录组进行比较分析,筛选出与雄花芽形态发育相关的差异基因。结果显示,转录组测序共获得40.48 Gb过滤数据,各样品的clean reads与杜仲基因组进行序列比对,比对效率为90.56%~93.01%。在2个发育时期筛选出583个差异表达基因,其中在雄蕊原基发育期上调基因315个,下调基因267个。差异基因GO和KEGG功能分析显示,差异基因富集在与生长发育、光周期途径、激素合成和信号传导、碳代谢等相关的生物过程和代谢通路。结果显示光周期途径是杜仲成花诱导的重要途径,同时雄花芽在形态分化过程中受碳水化合物、植物激素和其他代谢物质调控。此外,MADS-box家族成员FLCSOC1、AGL3和AGL8参与杜仲雄蕊器官发育。本研究为杜仲花发育基因调控提供了基础数据,也为雄花用杜仲的分子育种提供了参考。

关 键 词:杜仲  雄花芽  不同发育时期  转录组测序  差异表达基因  
收稿时间:2019-03-18
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