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利用DNA池和测序技术快速筛查SNPs及估算基因频率
引用本文:崔建勋,杜红丽,张细权.利用DNA池和测序技术快速筛查SNPs及估算基因频率[J].遗传学报,2005,32(4):372-377.
作者姓名:崔建勋  杜红丽  张细权
作者单位:华南农业大学动物科学学院,广州,510642
基金项目:国家重点基础研究发展规划项目(编号:G2000016102 )资助~~
摘    要:选取产蛋性能具有明显差异的4个鸡品种(莱航鸡、阳山鸡、丝羽乌骨鸡和隐性白洛克鸡)构建品种DNA池,采用测序的方法研究鸡催乳素基因5′侧翼调控区远端序列(1028bp)的多态性,快速筛查到8个可能与产蛋性能相关的SNPs(C-2402T、T-2192C、C-2161G、C-2134G、C-2062G、G-2040A、A-1944G和C-1884A)。进一步利用测序图中SNP等位基因峰高的比值估算各鸡品种等位基因的频率,其中C-2402T、C-2161G、C-1884A和C-2062G、G-2040A位点等位基因频率的估算结果分别被PCR-RFLP、PCR-SSCP所验证,说明测序峰高比值估算等位基因频率的方法具有一定的可行性。

关 键 词:DNA池  测序  单核苷酸多态性(SNPs)  基因频率
文章编号:0379-4172(2005)04-0372-06

Rapidly Screening SNPs and Estimating Allelic Frequencies by DNA Pooling and Sequencing
CUI Jian-Xun,DU Hong-Li,ZHANG Xi-quan.Rapidly Screening SNPs and Estimating Allelic Frequencies by DNA Pooling and Sequencing[J].Journal of Genetics and Genomics,2005,32(4):372-377.
Authors:CUI Jian-Xun  DU Hong-Li  ZHANG Xi-quan
Abstract:
Keywords:DNA pooling  sequencing  single nucleotide polymorphisms (SNPs)  allelic frequencies
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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