| 常见SPF级小鼠和大鼠肠道菌群多样性研究 |
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| 引用本文： | 黄树武,闵凡贵,王静,潘金春. 常见SPF级小鼠和大鼠肠道菌群多样性研究[J]. 中国实验动物学报, 2019, 0(2): 229-235 |
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| 作者姓名： | 黄树武 闵凡贵 王静 潘金春 |
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| 作者单位： | 广东省实验动物监测所广东省实验动物重点实验室 |
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| 基金项目： | 广东省科技计划项目(2016A030303024;2017B030314171;2017A070702001;2018B030317001)~~ |
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| 摘 要： | 目的研究常见SPF级小鼠和大鼠的肠道菌群多样性。方法分别采集广东地区三家实验动物生产单位的C57BL/6、ICR、BALB/c小鼠和Wistar、SD大鼠的盲肠内容物样品,用细菌16S rDNA通用引物扩增V4-V5区域,采用Illumina Miseq 2×300 bp测序平台进行测序,使用生物信息学方法进行微生物群落分析、Alpha多样性分析与Beta多样性分析。结果对序列去杂优化后OTU聚类分析,稀释性曲线说明本次测序的数据量合理;实验小鼠和大鼠肠道菌群共分成八个门,其中拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)占据主要地位,属水平上主要是拟杆菌属(Bacteroides)、Hungatella、副杆状菌属(Parabacteroides)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)等;样品间差异性分析显示相同设施来源动物的菌群组成相似性较高;Alpha分析结果显示来源于同种设施的动物物种丰富度相近;Beta分析显示相同设施动物的肠道菌群差异较小,但品系对肠道菌群差异性有所影响。结论不同来源设施的饲养环境是动物肠道菌群多样性的主要影响因素,不同品系对肠道菌群多样性有一定影响。
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| 关 键 词： | 小鼠 大鼠 肠道菌群 Illuminamiseq |
Diversity of intestinal flora in commonly used SPF mice and rats |
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| HUANG Shuwu,MIN Fangui,WANG Jing,PAN Jinchun. Diversity of intestinal flora in commonly used SPF mice and rats[J]. Acta Laboratorium Animalis Scientia Sinica, 2019, 0(2): 229-235 |
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| Authors: | HUANG Shuwu MIN Fangui WANG Jing PAN Jinchun |
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| Affiliation: | (Guangdong Laboratory Animals Monitoring Institute, Guangdong Provincial Key Laboratory of Laboratory Animals, Guangzhou 510663, China) |
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| Abstract: | HUANG Shuwu;MIN Fangui;WANG Jing;PAN Jinchun(Guangdong Laboratory Animals Monitoring Institute, Guangdong Provincial Key Laboratory of Laboratory Animals, Guangzhou 510663, China) |
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| Keywords: | mice rats intestinal flora Illumina Miseq |
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