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基因表达谱芯片杂交影响因素的初步研究
引用本文:祝骥,马文丽,李凌,毛向明,郑文岭.基因表达谱芯片杂交影响因素的初步研究[J].生命科学研究,2004,8(2):133-139.
作者姓名:祝骥  马文丽  李凌  毛向明  郑文岭
作者单位:1. 第一军医大学,分子生物学研究所,中国广东,广州,510515;中国科学院,华南植物研究所,中国广东,广州,510650
2. 第一军医大学,分子生物学研究所,中国广东,广州,510515
3. 广州军区广州总医院,分子肿瘤研究所,中国广东,广州,510010
基金项目:国家自然科学基金(39880032)
摘    要:通过对K562细胞基因表达谱芯片杂交影响因素的研究表明,用限制性显示技术制备的cDNA探针长度较均一,适合基因芯片杂交;在42℃条件下含甲酰胺的杂交液中杂交16.20h,可保证样品的有效杂交。并表现出很好的杂交特异性;用RD-PCR或线性PCR对少量样品进行扩增,并用荧光(Cy3或Cy5)标记的通用引物对样品进行标记,可提高芯片检测的灵敏度;一次杂交反应总RNA的用量仅需0.5~10μg,在每cm^2约含1000~1500个点的阵列中杂交时,标记样品用量1~2μg为宜;用PCR产物纯化柱对荧光标记产物进行纯化,可大大减小背景荧光,提高信噪比;同一批芯片经同一样品杂交结果的重复性很好,相关系数高达97.8%

关 键 词:K562细胞  基因芯片  基因表达谱  杂交  限制性显示
文章编号:1007-7847(2004)02-0133-07
修稿时间:2003年10月7日

Studies of Effect Factors on the Hybridization of Gene Expression Microarray
ZHU Ji,MA Wen li,LI Ling,MAO Xiang ming,ZHENG Wen ling.Studies of Effect Factors on the Hybridization of Gene Expression Microarray[J].Life Science Research,2004,8(2):133-139.
Authors:ZHU Ji    MA Wen li  LI Ling  MAO Xiang ming  ZHENG Wen ling
Institution:ZHU Ji1,2,MA Wen li1,LI Ling1,MAO Xiang ming1,ZHENG Wen ling3
Abstract:
Keywords:K562 cell  gene chip  gene expression profile  hybridization  restriction display  
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