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人血管内皮细胞缺氧早期基因系列表达分析文库的建立及分析
引用本文:梁光萍,苏踊跃,陈建,罗向东,陈渝.人血管内皮细胞缺氧早期基因系列表达分析文库的建立及分析[J].现代生物医学进展,2009,9(18).
作者姓名:梁光萍  苏踊跃  陈建  罗向东  陈渝
作者单位:1. 第三军医大学西南医院全军烧伤研究所,创伤、烧伤与复合伤国家重点实验室,重庆,400038
2. 昆明军区总医院,云南,昆明,650000
基金项目:,国家重点基础研究发展规划项目973项日,国家自然科学基金面上项目
摘    要:目的:建立常氧及缺氧早期人血管内皮细胞基因系列表达分析文库,对表达谱数据进行初步分析,为创伤后多器官功能障碍的防治奠定基础.方法:体外培养人脐静脉内皮细胞株(EA.hy926),分为正常对照组和缺氧3h处理组.采用长标签基因系列表达分析方法(Long SAGE)建立常氧及缺氧3h组人血管内皮细胞基因表达文库,通过与Genebank数据库比对确认基因,对所得标签进行初步分析.结果:通过Long SAGE技术构建了常氧和缺氧脐静脉内皮细胞Long SAGE文库.缺氧SAGE文库测得30756个标签,其中识别出的基因总数为13879,比例为45.13%;重复的双标签体总数为762.常氧SAGE文库测得标签数为31213,其中识别出的基因总数为13665,比例为43.78%;重复的双标签体总教为758.结论:成功建立了人脐静脉内皮细胞常氧和缺氧早期LongSAGE文库,获得涵盖上万个转录本信息的表达谱数据,为创伤后多器官功能障碍的防治奠定基础.

关 键 词:基因系列表达分析  血管内皮细胞  缺氧  基因表达谱

Establishment and Gross Analysis of Serial Analysis of Gene Expression Libraries of Human Vascular Endothelial Cell before and after Hypoxia
LIANG Guang-ping,SU Yong-yue,CHEN Jian,LUO Xiang-dong,CHEN Yu.Establishment and Gross Analysis of Serial Analysis of Gene Expression Libraries of Human Vascular Endothelial Cell before and after Hypoxia[J].Progress in Modern Biomedicine,2009,9(18).
Authors:LIANG Guang-ping  SU Yong-yue  CHEN Jian  LUO Xiang-dong  CHEN Yu
Abstract:
Keywords:
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