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| 真核基因起始与终止密码子旁侧序列特征分析 | |
| 引用本文： | 翁景然,张宏,耿美英,张成岗. 真核基因起始与终止密码子旁侧序列特征分析[J]. 生物信息学, 2004, 2(4): 10-14 |
| 作者姓名： | 翁景然 张宏 耿美英 张成岗 |
| 作者单位： | 1. 军事医学科学院放射医学研究所,北京,100850;北京工业大学应用数理学院,北京,100022 2. 军事医学科学院放射医学研究所,北京,100850 3. 北京工业大学应用数理学院,北京,100022 |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划 (973计划 ) (2 0 0 3CB715 90 0 )，国家高技术研究发展计划 (863计划 ) (2 0 0 2AA2 3 40 2 1)资助。 |
| 摘 要： | 真核基因起始与终止密码子旁侧序列的特征对于确定cDNA开放阅读框架 (ORF)和预测基因组序列中的编码区 (CDS)非常重要。基于高质量RefSeq数据库 ,在较大数据规模下统计分析了起始密码子旁侧序列所具有的“Kozak规则” ,发现不同物种之间存在差别。同时分析了不同终止密码子旁侧序列的统计学特征 ,给出了相应的正则表达式。由于发现多种基因中存在同相位起始、终止密码子串联使用的情况 ,亦对此进行了讨论。 |
| 关 键 词： | 真核基因 cDNA序列 起始密码子 终止密码子 序列特征 Kozak规则 |
| 文章编号： | 1672-5565(2004)-04-0010-05 |
| 修稿时间： | 2004-07-07 |
Characteristic analysis of flanking sequence of start codon and stop codon in eukaryotic genes |
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| WENG Jing-ran ,,ZHANG Hong,GENG Mei-ying,ZHANG Cheng-gang. Characteristic analysis of flanking sequence of start codon and stop codon in eukaryotic genes[J]. Chinese Journal of Bioinformatics, 2004, 2(4): 10-14 | |
| Authors: | WENG Jing-ran ZHANG Hong GENG Mei-ying ZHANG Cheng-gang |
| Affiliation: | WENG Jing-ran 1,2,ZHANG Hong1,GENG Mei-ying2,ZHANG Cheng-gang 1* |
| Abstract: | |
| Keywords: | eukaryotic gene cDNA sequence start codon stop codon sequence character Kozak rule |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ | |