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同义密码子通过精微翻译选择机制实现对基因的表达调控
引用本文:冯茜莉,王慧慧,汪梦竹,赵泽阳,周建华.同义密码子通过精微翻译选择机制实现对基因的表达调控[J].微生物学报,2022,62(10):3681-3695.
作者姓名:冯茜莉  王慧慧  汪梦竹  赵泽阳  周建华
作者单位:西北民族大学, 生物医学研究中心, 甘肃 兰州 730030;西北民族大学, 生命科学与工程学院, 甘肃 兰州 730010;西北民族大学, 生物医学研究中心, 甘肃 兰州 730030;中国农业科学院, 兰州兽医研究所, 甘肃 兰州 730046
基金项目:西北民族大学引进人才科研项目(xbmuyjrc202225);国家自然科学基金(31302100)
摘    要:自然界中,同义密码子的存在使得众多氨基酸能够同时被多种密码子编码合成。随着研究的深入,同义密码子使用偏嗜性发挥出的生物学功能已经渗透到了基因复制、转录、翻译以及化学修饰等生命活动过程中。基于同义密码子使用偏嗜性的生物学特性,陆续发现密码子对(codon pair)和密码子共现(codon co-occurrence)同样在使用模式上存在明显的偏嗜性。在基因表达的过程中,针对编码序列的密码子优化能够显著提升基因的表达水平,这在生物工程领域对于蛋白表达有着重要的生物学意义。此外,同义密码子使用模式在调控基因转录、化学修饰以及翻译过程中间接控制着细胞内生命活动的有序性。而这些与同义密码子使用模式有着千丝万缕联系的生命过程主要是受精微翻译选择压力来调控运行的。本文中,我们结合当前同义密码子使用模式介导的精微翻译选择压力,简述密码子使用模式如何从转录、化学修饰以及翻译等方面来影响基因表达及蛋白产物生物学功能。这将为今后生物工程学领域如何优化蛋白高效表达以及深入研究重要生物学活动中基因表达调控提供可参考的思路与理念。

关 键 词:同义密码子  精微翻译选择压力  调控  基因表达  生物工程
收稿时间:2022/2/12 0:00:00
修稿时间:2022/4/17 0:00:00

Regulation of fine-tuning translation selection mediated by synonymous codon usage for gene expression
FENG Xili,WANG Huihui,WANG Mengzhu,ZHAO Zeyang,ZHOU Jianhua.Regulation of fine-tuning translation selection mediated by synonymous codon usage for gene expression[J].Acta Microbiologica Sinica,2022,62(10):3681-3695.
Authors:FENG Xili  WANG Huihui  WANG Mengzhu  ZHAO Zeyang  ZHOU Jianhua
Institution:Biomedical Research Center, Northwest Minzu University, Lanzhou 730030, Gansu, China;Life Science and Engineering College, Northwest Minzu University, Lanzhou 730010, Gansu, China; Biomedical Research Center, Northwest Minzu University, Lanzhou 730030, Gansu, China;Lanzhou Veterinary Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou 730046, Gansu, China
Abstract:
Keywords:synonymous codon  fine-tuning translation selection  mediation  gene expression  biological engineering
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