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| 裸燕麦Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列的分离、鉴定与分析 | |
| 引用本文： | 郭晓芳,贾举庆,张晓军,张春来,张美俊,冯美臣,杨武德. 裸燕麦Ty1-copia类反转录转座子反转录酶序列的分离、鉴定与分析[J]. 植物科学学报, 2018, 36(5): 721-728. DOI: 10.11913/PSJ.2095-0837.2018.50721 |
| 作者姓名： | 郭晓芳 贾举庆 张晓军 张春来 张美俊 冯美臣 杨武德 |
| 作者单位： | 1. 山西农业大学农学院, 山西太谷 030801; 2. 山西省农业科学院作物科学研究所, 太原 030032 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31101199）；山西省应用基础研究计划项目（201601D102047，201601D102051）；山西省重点研发计划重点项目（201703D211001-03-01）；山西省农谷建设科研专项（SXNGJSKYZX201702）；山西农业大学专业提升计划项目（TSJH1406）。 |
| 摘 要： | 本研究根据Ty1-copia类反转录转座子反转录酶的保守区设计简并引物,通过PCR扩增,从裸燕麦(Avena nuda L.)品种‘品燕1号’基因组中分离获得23条Ty1-copia类反转录转座子序列,并对序列特征、系统发育关系及其转录活性进行分析。结果显示,23条Ty1-copia类反转录转座子存在较高的异质性,序列间的一致性为45%～98%,存在插入、移码和终止密码突变,但频率不高;系统发育分析结果表明,燕麦Ty1-copia类反转录转座子在进化过程中主要为垂直传递。本研究通过检索燕麦基因表达数据库,发现了5个有转录活性的Ty1-copia类反转录转座子。 |
| 关 键 词： | 裸燕麦 Ty1-copia类反转录转座子 进化 转录活性 |
| 收稿时间： | 2018-04-17 |
Isolation,identification and characterization of reverse transcriptase sequence from Ty1-copia retrotransposon in Avena nuda |
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| Guo Xiao-Fang,Jia Ju-Qing,Zhang Xiao-Jun,Zhang Chun-Lai,Zhang Mei-Jun,Feng Mei-Chen,Yang Wu-De. Isolation,identification and characterization of reverse transcriptase sequence from Ty1-copia retrotransposon in Avena nuda[J]. Plant Science Journal, 2018, 36(5): 721-728. DOI: 10.11913/PSJ.2095-0837.2018.50721 | |
| Authors: | Guo Xiao-Fang Jia Ju-Qing Zhang Xiao-Jun Zhang Chun-Lai Zhang Mei-Jun Feng Mei-Chen Yang Wu-De |
| Affiliation: | 1. College of Agronomy, Shanxi Agricultural University, Taigu, Shanxi 030801, China; 2. Institute of Crop Science, Shanxi Academy of Agricultural Science, Taiyuan 030032, China |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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