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绰墩山遗址古水稻土细菌与古菌群落的PCR-DGGE分析
引用本文:申卫收,,尹睿,,林先贵,,褚海燕,,胡正义,曹志洪,. 绰墩山遗址古水稻土细菌与古菌群落的PCR-DGGE分析[J]. 生态学报, 2008, 28(6): 2916-2916~2924
作者姓名:申卫收    尹睿    林先贵    褚海燕    胡正义  曹志洪  
作者单位:1. 中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室,南京,210008;中国科学院南京土壤研究所-香港浸会大学土壤与环境联合开放实验室,南京,210008;中国科学院研究生院,北京,100049
2. 中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室,南京,210008;中国科学院南京土壤研究所-香港浸会大学土壤与环境联合开放实验室,南京,210008
3. 中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室,南京,210008
摘    要:在江苏苏州绰墩山遗址考古发掘中,发现了在剖面不同深度埋藏的距今约6280 a的新石器时期灌溉古水稻田土层和距今约3320 a的商周时期的古水稻田土层.为了解古代水稻种植活动对土壤中细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性的影响,以土壤剖面P-01(包含100~116 cm新石器时期水稻土,42~57 cm商周时期水稻土,0~15 cm现代水稻土和174~200 cm土壤母质)为对象, 利用细菌、古菌及产甲烷古菌群落16S rDNA的高可变区V3区的PCR-DGGE分析技术,研究了不同土层细菌、古菌及产甲烷古菌群落多样性.结果表明:利用PCR-DGGE技术成功获得了古水稻土细菌、古菌及产甲烷古菌群落的分子指纹图谱.现代水稻土、商周时期古水稻土和新石器时期古水稻土中细菌、古菌及产甲烷古菌群落的DGGE条带类型各不相同, 并且DGGE条带类型都较母质层丰富多样.UPGAMA聚类分析可以将不同时期水稻土及母质层的细菌、古菌及产甲烷古菌群落区分开来.埋藏古水稻土中仍有较多的细菌、古菌与产甲烷古菌存活.与母质层相比,不同时期水稻种植活动均增加了细菌、古菌与产甲烷古菌群落多样性.不同时期水稻种植活动可以引起特异性的细菌、古菌与产甲烷古菌群落发育,而且不同的栽培措施可能导致不同的优势种群.

关 键 词:古水稻土  新石器时代  DGGE  古菌  产甲烷古菌  遗址  古水稻土  细菌  菌群  聚类分析  Site  paddy soils  ancient  community  bacterial  analyses  优势种群  栽培措施  发育  层相  落区  时期  丰富多样  类型  DGGE
收稿时间:2007-03-23
修稿时间:2007-12-12

PCR-DGGE analyses of bacterial and archaeal community diversities in ancient paddy soils discovered in Chuodunshan Site, Suzhou, China
SHEN,nbsp;Wei-Shou,,nbsp;YIN,nbsp;Rui,,nbsp;LIN,nbsp;Xian-Gui,,nbsp;CHU,nbsp;Hai-Yan,,nbsp;HU,nbsp;Zheng-Yi,,nbsp;CAO,nbsp;Zhi-Hong,,nbsp;. PCR-DGGE analyses of bacterial and archaeal community diversities in ancient paddy soils discovered in Chuodunshan Site, Suzhou, China[J]. Acta Ecologica Sinica, 2008, 28(6): 2916-2916~2924
Authors:SHEN   Wei-Shou,   YIN   Rui,   LIN   Xian-Gui,   CHU   Hai-Yan,   HU   Zheng-Yi,   CAO   Zhi-Hong,   
Affiliation:1 State Key Laboratory of Soil and Sustainable Agriculture, Institute of Soil Science, Chinese Academy of Sciences, Nanjing 210008, China 
2 Joint Open Laboratory of Soil and the Environment, Institute of Soil Science and Hong Kong Baptist University, Nanjing 210008, China
3 Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China
Abstract:
Keywords:ancient paddy soils   Neolithic age   DGGE   archaea   methanogenic archaea
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