长链非编码RNA的作用机制及其研究方法 |
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引用本文: | 夏天,肖丙秀,郭俊明. 长链非编码RNA的作用机制及其研究方法[J]. 遗传, 2013, 35(3): 269-280. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2013.00269 |
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作者姓名: | 夏天 肖丙秀 郭俊明 |
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作者单位: | 宁波大学医学院生物化学与分子生物学研究所, 浙江省病理生理学技术研究重点实验室, 宁波 315211 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(编号:81171660), 宁波市自然科学基金项目(编号:2012A610207), 宁波市科技创新团队项目(编号:2011B82014), 宁波市重点学科项目(编号:XKL11D2127)和宁波大学优秀学位论文培育基金项目(编号:PY2012004)资助 |
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摘 要: | 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)通过多种机制发挥其生物学功能, 这些机制包括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA降解和翻译调控等。lncRNA通过这些作用机制在不同水平进行基因表达调控。在研究lncRNA功能的过程中, 研究方法的建立和应用起着非常重要的作用。目前用于lncRNA研究的主要方法有:微阵列、转录组测序、Northern印迹、实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应、荧光原位杂交、RNA干扰和RNA结合蛋白免疫沉淀等。文章着重介绍了3种前沿方法, 即:在线快速预测RNA与蛋白质相互作用的catRAPID、RNA纯化的染色质分离(Chromatin isolation by RNA purification, ChIRP)以及非编码RNA沉默与定位分析技术(Combined knockdown and localization analysis of non-coding RNAs, c-KLAN)。
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关 键 词: | 基因表达调控 研究方法 长链非编码RNA 作用机制 |
收稿时间: | 2012-08-08 |
Acting mechanisms and research methods of long noncoding RNAs |
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Affiliation: | Department of Biochemistry and Molecular Biology, Ningbo University School of Medicine, Zhejiang Provincial Key Laboratory of Pathophysiology, Ningbo 315211, China |
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Abstract: | |
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Keywords: | gene expression regulation research methods long non-coding RNAs (lncRNAs) acting mechanisms |
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