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马铃薯HXK基因家族鉴定及表达特征分析
引用本文:王言,何雷,刘涛涛,王玺,韩佳,杨宏羽.马铃薯HXK基因家族鉴定及表达特征分析[J].西北植物学报,2023,43(12):2018-2029.
作者姓名:王言  何雷  刘涛涛  王玺  韩佳  杨宏羽
作者单位:甘肃农业大学园艺学院
基金项目:国际马铃薯中心-甘肃农业大学联合研发中心项目(701-03619028);甘肃省科技计划项目(20JR10RA529);甘肃省现代丝路寒旱农业发展项目(701-03422008);
摘    要:为探究马铃薯HXK家族的功能,本研究利用生物信息学方法,对马铃薯HXK基因家族成员进行鉴定,并采用实时荧光定量PCR对该基因在不同模拟逆境胁迫下的表达进行分析。研究利用同源比对方法从马铃薯基因组中鉴定获得到6个马铃薯HXK基因,分别命名为StHXK1-StHXK6。该家族基因分别分布于马铃薯的6条染色体上,其编码蛋白长度为497~533 aa,等电点为5.36~6.11,分子质量在53 736.38~58 184.71 Da,均为亲水蛋白。亚细胞定位预测表明,StHXK家族成员主要在叶绿体中表达。该家族成员二级结构均以α-螺旋和不规则卷曲为主,三级结构高度相似。顺势元件分析发现马铃薯HXK基因主要包含光响应元件、激素响应元件、胁迫响应元件及生长发育相关元件。qRT- PCR结果表明,StHXK基因在ABA诱导下均上调表达显著,50 μmol/L ABA胁迫下,StHXK1和StHXK2在处理24 h相对表达量较高,分别为对照的286.4倍和152.02倍,200 mmol/L NaCl处理下,除StHXK1和StHXK4基因相对表达量在处理时间2 h呈上调表达,其余StHXK基因均呈不同程度的下调表达。在10% PEG胁迫处理下,StHXK基因相对表达量呈不同程度的上调表达。综上所述,StHXK基因对ABA、NaCl和PEG胁迫处理均存在不同程度的响应。

关 键 词:马铃薯  HXK基因家族  表达分析  非生物胁迫
收稿时间:2023/4/27 0:00:00
修稿时间:2023/6/6 0:00:00

Identification and Expression Characterization of HXK Gene Family in Potato (Solanum tuberosum)
WANG Yan,HE Lei,LIU Taotao,WANG Xi,HAN Ji,YANG Hongyu.Identification and Expression Characterization of HXK Gene Family in Potato (Solanum tuberosum)[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2023,43(12):2018-2029.
Authors:WANG Yan  HE Lei  LIU Taotao  WANG Xi  HAN Ji  YANG Hongyu
Abstract:
Keywords:Potato  HXK gene family  expression analysis  abiotic stress
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