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胞质雄性不育白菜叶绿体ndhJ-trnF区域序列发生变异
引用本文:蒋明,曹家树. 胞质雄性不育白菜叶绿体ndhJ-trnF区域序列发生变异[J]. 生物化学与生物物理进展, 2007, 34(5): 497-502
作者姓名:蒋明  曹家树
作者单位:浙江大学蔬菜研究所细胞与分子生物学实验室,杭州 310029;浙江大学蔬菜研究所细胞与分子生物学实验室,杭州 310029
基金项目:浙江省重大科技项目(2005C12019-02)和国家自然科学基金资助项目(30370975).
摘    要:以来自Polima胞质甘蓝型油菜雄性不育源转育获得的不育白菜‘Bpol97-05A’和其回交亲本即保持系‘Bajh97-01B’为材料,利用cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP)技术获得一条长约330 bp的特异片段P1708,RT-PCR验证确认该序列为不育白菜材料所特有,经测序和BLAST比对,发现该片段除54 bp的插入序列外,其余部分与大白菜和甘蓝叶绿体ndhJ-trnF基因之间的一段序列完全一致. 根据基因区域两端的保守部位设计引物,以Polima不育白菜DNA和可育甘蓝型油菜的DNA为模板,分别获得了长约1 900 bp的序列,比较序列发现:不育白菜与可育白菜、甘蓝型油菜的DNA序列存在一定差异,‘Bpol97-05A’中除多个位点发生变异外,另有108 bp的插入序列,该插入由2个长度为54 bp的重复序列组成,重复序列中除5′端3个碱基CTT外,其余部分均与trnF基因3′端51 bp完全相同.

关 键 词:白菜,cDNA扩增片段长度多态性(cDNA-AFLP),ndhJ- trnF区域,序列变异,细胞质雄性不育,叶绿体基因
收稿时间:2006-11-02
修稿时间:2006-11-12

cDNA-AFLP Reveals Variation of Sequence Region trnF-ndhJ in Cytoplasmic Male Sterile Chinese Cabbage-pak-choi
JIANG Ming and CAO Jia-Shu. cDNA-AFLP Reveals Variation of Sequence Region trnF-ndhJ in Cytoplasmic Male Sterile Chinese Cabbage-pak-choi[J]. Progress In Biochemistry and Biophysics, 2007, 34(5): 497-502
Authors:JIANG Ming and CAO Jia-Shu
Affiliation:Laboratory of Cell & Molecular Biology, Institute of Vegetable Science, Zhejiang University, Hangzhou 310029, China;Laboratory of Cell & Molecular Biology, Institute of Vegetable Science, Zhejiang University, Hangzhou 310029, China
Abstract:
Keywords:Chinese cabbage-pak-choi   cDNA amplified fragment length polymorphism(cDNA-AFLP)   ndhJ-trnF gene region   sequence variation   cytoplasmic male sterility   chloroplast gene
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